Protein–RNA interactions for Protein: Q08EG8

Krtap10-4, Keratin-associated protein 10-4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap10-4Q08EG8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Krtap10-4Q08EG8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap10-4Q08EG8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Krtap10-4Q08EG8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Krtap10-4Q08EG8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krtap10-4Q08EG8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Krtap10-4Q08EG8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Krtap10-4Q08EG8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap10-4Q08EG8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Krtap10-4Q08EG8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Krtap10-4Q08EG8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap10-4Q08EG8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap10-4Q08EG8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap10-4Q08EG8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Krtap10-4Q08EG8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Krtap10-4Q08EG8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Krtap10-4Q08EG8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Krtap10-4Q08EG8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Krtap10-4Q08EG8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krtap10-4Q08EG8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Krtap10-4Q08EG8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krtap10-4Q08EG8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krtap10-4Q08EG8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Krtap10-4Q08EG8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krtap10-4Q08EG8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Krtap10-4Q08EG8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap10-4Q08EG8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Krtap10-4Q08EG8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap10-4Q08EG8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap10-4Q08EG8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Krtap10-4Q08EG8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krtap10-4Q08EG8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Krtap10-4Q08EG8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krtap10-4Q08EG8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Krtap10-4Q08EG8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Krtap10-4Q08EG8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Krtap10-4Q08EG8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Krtap10-4Q08EG8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap10-4Q08EG8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap10-4Q08EG8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap10-4Q08EG8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Krtap10-4Q08EG8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Krtap10-4Q08EG8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krtap10-4Q08EG8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Krtap10-4Q08EG8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms