Protein–RNA interactions for Protein: Q08924

RTT10, Regulator of Ty1 transposition protein 10, yeastyeast

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTT10Q08924 FPS1YLL043W 2010 nt12.1□□□□□ -0.47
RTT10Q08924 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.06□□□□□ -0.48
RTT10Q08924 DSK2YMR276W 1122 nt12.06□□□□□ -0.48
RTT10Q08924 FMP45YDL222C 930 nt12.03□□□□□ -0.48
RTT10Q08924 IMP2'YIL154C 1041 nt12.03□□□□□ -0.48
RTT10Q08924 YPR011CYPR011C 981 nt12.02□□□□□ -0.49
RTT10Q08924 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.01□□□□□ -0.49
RTT10Q08924 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.01□□□□□ -0.49
RTT10Q08924 ALF1YNL148C 765 nt12□□□□□ -0.49
RTT10Q08924 YLR236CYLR236C 324 nt11.98□□□□□ -0.49
RTT10Q08924 MEP2YNL142W 1500 nt11.92□□□□□ -0.5
RTT10Q08924 YCH1YGR203W 447 nt11.92□□□□□ -0.5
RTT10Q08924 YPS1YLR120C 1710 nt11.91□□□□□ -0.5
RTT10Q08924 YDR095CYDR095C 411 nt11.88□□□□□ -0.51
RTT10Q08924 YJL152WYJL152W 360 nt11.88□□□□□ -0.51
RTT10Q08924 NME1NME1 340 nt11.84□□□□□ -0.51
RTT10Q08924 SIS1YNL007C 1059 nt11.81□□□□□ -0.52
RTT10Q08924 MRPL8YJL063C 717 nt11.8□□□□□ -0.52
RTT10Q08924 IDH1YNL037C 1083 nt11.78□□□□□ -0.52
RTT10Q08924 LPX1YOR084W 1164 nt11.77□□□□□ -0.53
RTT10Q08924 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.76□□□□□ -0.53
RTT10Q08924 ERV46YAL042W 1248 nt11.76□□□□□ -0.53
RTT10Q08924 DCW1YKL046C 1350 nt11.72□□□□□ -0.53
RTT10Q08924 TIR4YOR009W 1464 nt11.7□□□□□ -0.54
RTT10Q08924 YDR433WYDR433W 441 nt11.69□□□□□ -0.54
RTT10Q08924 RPP2AYOL039W 321 nt11.67□□□□□ -0.54
RTT10Q08924 SPP1YPL138C 1062 nt11.67□□□□□ -0.54
RTT10Q08924 ADO1YJR105W 1023 nt11.65□□□□□ -0.54
RTT10Q08924 YKR040CYKR040C 504 nt11.64□□□□□ -0.55
RTT10Q08924 GBP2YCL011C 1284 nt11.63□□□□□ -0.55
RTT10Q08924 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.6□□□□□ -0.55
RTT10Q08924 YEL076CYEL076C 651 nt11.6□□□□□ -0.55
RTT10Q08924 YLR464WYLR464W 651 nt11.6□□□□□ -0.55
RTT10Q08924 ART5YGR068C 1761 nt11.59□□□□□ -0.55
RTT10Q08924 CAC2YML102W 1407 nt11.58□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 PTP1YDL230W 1008 nt11.57□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 RTG1YOL067C 534 nt11.57□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 EMI2YDR516C 1503 nt11.56□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 PET9YBL030C 957 nt11.55□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 YMR057CYMR057C 372 nt11.55□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 MXR2YCL033C 507 nt11.55□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 YMR090WYMR090W 684 nt11.54□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.53□□□□□ -0.56
RTT10Q08924 UME6YDR207C 2511 nt11.51□□□□□ -0.57
RTT10Q08924 GFD2YCL036W 1701 nt11.5□□□□□ -0.57
RTT10Q08924 YBR220CYBR220C 1683 nt11.49□□□□□ -0.57
RTT10Q08924 TCD2YKL027W 1344 nt11.46□□□□□ -0.57
RTT10Q08924 YDL221WYDL221W 552 nt11.44□□□□□ -0.58
RTT10Q08924 UBX6YJL048C 1191 nt11.43□□□□□ -0.58
RTT10Q08924 SDH1YKL148C 1923 nt11.38□□□□□ -0.59
RTT10Q08924 HUA1YGR268C 597 nt11.37□□□□□ -0.59
RTT10Q08924 DED1YOR204W 1815 nt11.35□□□□□ -0.59
RTT10Q08924 FRD1YEL047C 1413 nt11.33□□□□□ -0.6
RTT10Q08924 RRD1YIL153W 1182 nt11.32□□□□□ -0.6
RTT10Q08924 RTS2YOR077W 699 nt11.31□□□□□ -0.6
RTT10Q08924 GUT2YIL155C 1950 nt11.25□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 PCH2YBR186W 1695 nt11.25□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 YCL042WYCL042W 360 nt11.25□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 SCC4YER147C 1875 nt11.25□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 YDR094WYDR094W 336 nt11.24□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 IRC15YPL017C 1500 nt11.24□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 PTH1YHR189W 573 nt11.22□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 CUE1YMR264W 612 nt11.22□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 SOR2YDL246C 1074 nt11.21□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 SOR1YJR159W 1074 nt11.21□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 FMT1YBL013W 1206 nt11.21□□□□□ -0.61
RTT10Q08924 YKL030WYKL030W 606 nt11.19□□□□□ -0.62
RTT10Q08924 YLR235CYLR235C 399 nt11.19□□□□□ -0.62
RTT10Q08924 SEC11YIR022W 504 nt11.17□□□□□ -0.62
RTT10Q08924 GIS3YLR094C 1509 nt11.15□□□□□ -0.62
RTT10Q08924 YGR139WYGR139W 339 nt11.14□□□□□ -0.63
RTT10Q08924 FMP52YER004W 696 nt11.13□□□□□ -0.63
RTT10Q08924 LCB1YMR296C 1677 nt11.1□□□□□ -0.63
RTT10Q08924 YIL100WYIL100W 354 nt11.09□□□□□ -0.63
RTT10Q08924 CWP1YKL096W 720 nt11.08□□□□□ -0.64
RTT10Q08924 PIB2YGL023C 1908 nt11.07□□□□□ -0.64
RTT10Q08924 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.07□□□□□ -0.64
RTT10Q08924 YSC84YHR016C 1407 nt11.06□□□□□ -0.64
RTT10Q08924 BOR1YNL275W 1731 nt11.05□□□□□ -0.64
RTT10Q08924 ADH2YMR303C 1047 nt11.04□□□□□ -0.64
RTT10Q08924 MCH5YOR306C 1566 nt10.98□□□□□ -0.65
RTT10Q08924 TIM23YNR017W 669 nt10.97□□□□□ -0.65
RTT10Q08924 DIC1YLR348C 897 nt10.95□□□□□ -0.66
RTT10Q08924 YHL050CYHL050C 2094 nt10.94□□□□□ -0.66
RTT10Q08924 PCM1YEL058W 1674 nt10.94□□□□□ -0.66
RTT10Q08924 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.93□□□□□ -0.66
RTT10Q08924 SNF6YHL025W 999 nt10.93□□□□□ -0.66
RTT10Q08924 YLR179CYLR179C 606 nt10.9□□□□□ -0.66
RTT10Q08924 RTF1YGL244W 1677 nt10.89□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 RRT12YCR045C 1476 nt10.89□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 YFR018CYFR018C 1092 nt10.89□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 YNL195CYNL195C 786 nt10.88□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 YJL225CYJL225C 5277 nt10.86□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 PAU16YKL224C 372 nt10.86□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 YPR064WYPR064W 420 nt10.86□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 RNQ1YCL028W 1218 nt10.86□□□□□ -0.67
RTT10Q08924 YIH1YCR059C 777 nt10.83□□□□□ -0.68
RTT10Q08924 RRT5YFR032C 870 nt10.83□□□□□ -0.68
RTT10Q08924 TAD3YLR316C 969 nt10.81□□□□□ -0.68
RTT10Q08924 BOP3YNL042W 1191 nt10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.4 ms