Protein–RNA interactions for Protein: Q08639

Tfdp1, Transcription factor Dp-1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfdp1Q08639 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Tfdp1Q08639 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Tfdp1Q08639 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tfdp1Q08639 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tfdp1Q08639 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tfdp1Q08639 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Tfdp1Q08639 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Tfdp1Q08639 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tfdp1Q08639 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tfdp1Q08639 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tfdp1Q08639 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tfdp1Q08639 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tfdp1Q08639 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tfdp1Q08639 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tfdp1Q08639 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tfdp1Q08639 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tfdp1Q08639 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Tfdp1Q08639 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tfdp1Q08639 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Tfdp1Q08639 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Tfdp1Q08639 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Tfdp1Q08639 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tfdp1Q08639 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfdp1Q08639 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tfdp1Q08639 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tfdp1Q08639 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Tfdp1Q08639 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Tfdp1Q08639 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tfdp1Q08639 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tfdp1Q08639 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tfdp1Q08639 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tfdp1Q08639 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tfdp1Q08639 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tfdp1Q08639 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tfdp1Q08639 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tfdp1Q08639 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tfdp1Q08639 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tfdp1Q08639 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tfdp1Q08639 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tfdp1Q08639 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfdp1Q08639 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tfdp1Q08639 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tfdp1Q08639 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tfdp1Q08639 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tfdp1Q08639 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tfdp1Q08639 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tfdp1Q08639 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tfdp1Q08639 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tfdp1Q08639 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Tfdp1Q08639 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tfdp1Q08639 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tfdp1Q08639 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tfdp1Q08639 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tfdp1Q08639 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Tfdp1Q08639 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tfdp1Q08639 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tfdp1Q08639 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tfdp1Q08639 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tfdp1Q08639 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tfdp1Q08639 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Tfdp1Q08639 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tfdp1Q08639 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tfdp1Q08639 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfdp1Q08639 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Tfdp1Q08639 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tfdp1Q08639 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tfdp1Q08639 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tfdp1Q08639 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tfdp1Q08639 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tfdp1Q08639 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tfdp1Q08639 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Tfdp1Q08639 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Tfdp1Q08639 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tfdp1Q08639 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tfdp1Q08639 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tfdp1Q08639 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tfdp1Q08639 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tfdp1Q08639 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tfdp1Q08639 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Tfdp1Q08639 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tfdp1Q08639 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tfdp1Q08639 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tfdp1Q08639 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Tfdp1Q08639 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfdp1Q08639 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tfdp1Q08639 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tfdp1Q08639 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tfdp1Q08639 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms