Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Col9a2Q07643 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
Col9a2Q07643 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Col9a2Q07643 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col9a2Q07643 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Col9a2Q07643 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Col9a2Q07643 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Col9a2Q07643 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Col9a2Q07643 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Col9a2Q07643 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Col9a2Q07643 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Col9a2Q07643 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Col9a2Q07643 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Col9a2Q07643 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Col9a2Q07643 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
Col9a2Q07643 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Col9a2Q07643 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col9a2Q07643 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Col9a2Q07643 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Col9a2Q07643 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Col9a2Q07643 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Col9a2Q07643 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Col9a2Q07643 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Col9a2Q07643 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Col9a2Q07643 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Col9a2Q07643 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Col9a2Q07643 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Col9a2Q07643 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Col9a2Q07643 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Col9a2Q07643 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Col9a2Q07643 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Col9a2Q07643 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Col9a2Q07643 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Col9a2Q07643 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Col9a2Q07643 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Col9a2Q07643 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Col9a2Q07643 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Col9a2Q07643 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Col9a2Q07643 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Col9a2Q07643 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Col9a2Q07643 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Col9a2Q07643 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col9a2Q07643 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Col9a2Q07643 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Col9a2Q07643 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Col9a2Q07643 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Col9a2Q07643 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Col9a2Q07643 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Col9a2Q07643 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Col9a2Q07643 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Col9a2Q07643 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Col9a2Q07643 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col9a2Q07643 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Col9a2Q07643 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Col9a2Q07643 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Col9a2Q07643 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Col9a2Q07643 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Col9a2Q07643 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Col9a2Q07643 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Col9a2Q07643 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Col9a2Q07643 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col9a2Q07643 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Col9a2Q07643 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Col9a2Q07643 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Col9a2Q07643 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Col9a2Q07643 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Col9a2Q07643 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Col9a2Q07643 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col9a2Q07643 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col9a2Q07643 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Col9a2Q07643 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Col9a2Q07643 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Col9a2Q07643 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Col9a2Q07643 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Col9a2Q07643 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col9a2Q07643 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Col9a2Q07643 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Col9a2Q07643 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col9a2Q07643 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Col9a2Q07643 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Col9a2Q07643 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Col9a2Q07643 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col9a2Q07643 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Col9a2Q07643 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Col9a2Q07643 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col9a2Q07643 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Col9a2Q07643 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Col9a2Q07643 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Col9a2Q07643 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Col9a2Q07643 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Col9a2Q07643 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col9a2Q07643 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Col9a2Q07643 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms