Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NrepQ07475 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
NrepQ07475 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NrepQ07475 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NrepQ07475 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NrepQ07475 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NrepQ07475 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NrepQ07475 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NrepQ07475 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrepQ07475 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NrepQ07475 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NrepQ07475 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrepQ07475 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NrepQ07475 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrepQ07475 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NrepQ07475 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrepQ07475 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NrepQ07475 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NrepQ07475 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NrepQ07475 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NrepQ07475 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NrepQ07475 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NrepQ07475 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NrepQ07475 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NrepQ07475 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NrepQ07475 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrepQ07475 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NrepQ07475 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NrepQ07475 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NrepQ07475 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NrepQ07475 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NrepQ07475 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms