Protein–RNA interactions for Protein: Q06678

MRPL35, 54S ribosomal protein L35, mitochondrial, yeastyeast

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MRPL35Q06678 GFD2YCL036W 1701 nt11.02□□□□□ -0.65
MRPL35Q06678 RTS2YOR077W 699 nt11.02□□□□□ -0.65
MRPL35Q06678 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MRPL35Q06678 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.01□□□□□ -0.65
MRPL35Q06678 SEC11YIR022W 504 nt10.98□□□□□ -0.65
MRPL35Q06678 YSC84YHR016C 1407 nt10.96□□□□□ -0.65
MRPL35Q06678 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.91□□□□□ -0.66
MRPL35Q06678 YHL050CYHL050C 2094 nt10.89□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 PIB2YGL023C 1908 nt10.88□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.87□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 RRT12YCR045C 1476 nt10.87□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 PET9YBL030C 957 nt10.86□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 YGR021WYGR021W 873 nt10.85□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 HOM6YJR139C 1080 nt10.84□□□□□ -0.67
MRPL35Q06678 TIR4YOR009W 1464 nt10.83□□□□□ -0.68
MRPL35Q06678 SHU1YHL006C 453 nt10.82□□□□□ -0.68
MRPL35Q06678 CUE1YMR264W 612 nt10.82□□□□□ -0.68
MRPL35Q06678 MNP1YGL068W 585 nt10.79□□□□□ -0.68
MRPL35Q06678 YMR057CYMR057C 372 nt10.78□□□□□ -0.68
MRPL35Q06678 RTF1YGL244W 1677 nt10.77□□□□□ -0.69
MRPL35Q06678 NVJ2YPR091C 2313 nt10.75□□□□□ -0.69
MRPL35Q06678 YCH1YGR203W 447 nt10.73□□□□□ -0.69
MRPL35Q06678 YNL195CYNL195C 786 nt10.7□□□□□ -0.7
MRPL35Q06678 YIL100WYIL100W 354 nt10.69□□□□□ -0.7
MRPL35Q06678 FPS1YLL043W 2010 nt10.68□□□□□ -0.7
MRPL35Q06678 RKM5YLR137W 1104 nt10.68□□□□□ -0.7
MRPL35Q06678 MOT3YMR070W 1473 nt10.67□□□□□ -0.7
MRPL35Q06678 BOP3YNL042W 1191 nt10.65□□□□□ -0.7
MRPL35Q06678 PTK1YKL198C 1989 nt10.65□□□□□ -0.71
MRPL35Q06678 NPL3YDR432W 1245 nt10.58□□□□□ -0.72
MRPL35Q06678 YLR236CYLR236C 324 nt10.58□□□□□ -0.72
MRPL35Q06678 YJL152WYJL152W 360 nt10.57□□□□□ -0.72
MRPL35Q06678 NCP1YHR042W 2076 nt10.54□□□□□ -0.72
MRPL35Q06678 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.48□□□□□ -0.73
MRPL35Q06678 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.48□□□□□ -0.73
MRPL35Q06678 YFL054CYFL054C 1941 nt10.43□□□□□ -0.74
MRPL35Q06678 LCB1YMR296C 1677 nt10.41□□□□□ -0.74
MRPL35Q06678 YKL097CYKL097C 411 nt10.4□□□□□ -0.74
MRPL35Q06678 SPT8YLR055C 1809 nt10.34□□□□□ -0.75
MRPL35Q06678 YOL037CYOL037C 354 nt10.29□□□□□ -0.76
MRPL35Q06678 RRD1YIL153W 1182 nt10.27□□□□□ -0.77
MRPL35Q06678 BOR1YNL275W 1731 nt10.22□□□□□ -0.77
MRPL35Q06678 SIM1YIL123W 1431 nt10.22□□□□□ -0.77
MRPL35Q06678 WHI5YOR083W 888 nt10.21□□□□□ -0.77
MRPL35Q06678 DED1YOR204W 1815 nt10.19□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 PCM1YEL058W 1674 nt10.19□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 GBP2YCL011C 1284 nt10.19□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 LYS4YDR234W 2082 nt10.18□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 SWE1YJL187C 2460 nt10.16□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 FMT1YBL013W 1206 nt10.15□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 IDH1YNL037C 1083 nt10.15□□□□□ -0.78
MRPL35Q06678 FMP52YER004W 696 nt10.13□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 YLR281CYLR281C 468 nt10.13□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 YOR139CYOR139C 393 nt10.13□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 TCD2YKL027W 1344 nt10.11□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 ADH2YMR303C 1047 nt10.11□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 CWP1YKL096W 720 nt10.1□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 BIO4YNR057C 714 nt10.09□□□□□ -0.79
MRPL35Q06678 SNF6YHL025W 999 nt10.05□□□□□ -0.8
MRPL35Q06678 HSP60YLR259C 1719 nt10.04□□□□□ -0.8
MRPL35Q06678 MXR2YCL033C 507 nt10.01□□□□□ -0.81
MRPL35Q06678 YDR433WYDR433W 441 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL35Q06678 UME6YDR207C 2511 nt9.97□□□□□ -0.81
MRPL35Q06678 YJL225CYJL225C 5277 nt9.96□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 CRR1YLR213C 1269 nt9.93□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 GLK1YCL040W 1503 nt9.92□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 ERF2YLR246W 1080 nt9.92□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 DSK2YMR276W 1122 nt9.92□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 YPR011CYPR011C 981 nt9.92□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 FMP45YDL222C 930 nt9.91□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 PUS2YGL063W 1113 nt9.91□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 MIC10YCL057C-A 294 nt9.91□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 SOR2YDL246C 1074 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 SOR1YJR159W 1074 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 YLL053CYLL053C 459 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 YCL042WYCL042W 360 nt9.9□□□□□ -0.82
MRPL35Q06678 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt9.89□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 FUR4YBR021W 1902 nt9.89□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 YIH1YCR059C 777 nt9.88□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 ATF2YGR177C 1608 nt9.87□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 IMP2'YIL154C 1041 nt9.87□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 CCA1YER168C 1641 nt9.85□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 HEM12YDR047W 1089 nt9.85□□□□□ -0.83
MRPL35Q06678 ALG12YNR030W 1656 nt9.83□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 RNQ1YCL028W 1218 nt9.83□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 FRD1YEL047C 1413 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 LPX1YOR084W 1164 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 SNG1YGR197C 1644 nt9.82□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 MCH5YOR306C 1566 nt9.81□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 RAX1YOR301W 1308 nt9.8□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 TRM5YHR070W 1500 nt9.77□□□□□ -0.84
MRPL35Q06678 FTR1YER145C 1215 nt9.77□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 IMT4tM(CAU)E 72 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 IMT3tM(CAU)J3 72 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 IMT1tM(CAU)O1 72 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 IMT2tM(CAU)P 72 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 ERV46YAL042W 1248 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 YKR040CYKR040C 504 nt9.76□□□□□ -0.85
MRPL35Q06678 YFL067WYFL067W 528 nt9.75□□□□□ -0.85
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