Protein–RNA interactions for Protein: Q06344

ESF1, Pre-rRNA-processing protein ESF1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ESF1Q06344 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.22□□□□□ -0.13
ESF1Q06344 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.22□□□□□ -0.13
ESF1Q06344 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.22□□□□□ -0.13
ESF1Q06344 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.22□□□□□ -0.13
ESF1Q06344 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.22□□□□□ -0.13
ESF1Q06344 WHI5YOR083W 888 nt14.21□□□□□ -0.13
ESF1Q06344 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.2□□□□□ -0.14
ESF1Q06344 CAC2YML102W 1407 nt14.15□□□□□ -0.14
ESF1Q06344 EMI2YDR516C 1503 nt14.13□□□□□ -0.15
ESF1Q06344 ART5YGR068C 1761 nt14.11□□□□□ -0.15
ESF1Q06344 TIR4YOR009W 1464 nt14.1□□□□□ -0.15
ESF1Q06344 PUS2YGL063W 1113 nt14.08□□□□□ -0.16
ESF1Q06344 YCH1YGR203W 447 nt14.07□□□□□ -0.16
ESF1Q06344 GFD2YCL036W 1701 nt14.07□□□□□ -0.16
ESF1Q06344 PET9YBL030C 957 nt14.06□□□□□ -0.16
ESF1Q06344 YDL221WYDL221W 552 nt14.03□□□□□ -0.16
ESF1Q06344 YJL152WYJL152W 360 nt14.03□□□□□ -0.16
ESF1Q06344 YMR090WYMR090W 684 nt14.02□□□□□ -0.17
ESF1Q06344 IRC15YPL017C 1500 nt13.95□□□□□ -0.18
ESF1Q06344 IMP2'YIL154C 1041 nt13.94□□□□□ -0.18
ESF1Q06344 YMR057CYMR057C 372 nt13.93□□□□□ -0.18
ESF1Q06344 DSK2YMR276W 1122 nt13.91□□□□□ -0.18
ESF1Q06344 YBR220CYBR220C 1683 nt13.88□□□□□ -0.19
ESF1Q06344 SDH1YKL148C 1923 nt13.86□□□□□ -0.19
ESF1Q06344 YPR011CYPR011C 981 nt13.86□□□□□ -0.19
ESF1Q06344 YLR236CYLR236C 324 nt13.85□□□□□ -0.19
ESF1Q06344 RTS2YOR077W 699 nt13.85□□□□□ -0.19
ESF1Q06344 GIS3YLR094C 1509 nt13.85□□□□□ -0.19
ESF1Q06344 IDH1YNL037C 1083 nt13.81□□□□□ -0.2
ESF1Q06344 FPS1YLL043W 2010 nt13.79□□□□□ -0.2
ESF1Q06344 CUE1YMR264W 612 nt13.78□□□□□ -0.2
ESF1Q06344 SCC4YER147C 1875 nt13.78□□□□□ -0.2
ESF1Q06344 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.77□□□□□ -0.21
ESF1Q06344 FMP45YDL222C 930 nt13.72□□□□□ -0.21
ESF1Q06344 BDF1YLR399C 2061 nt13.71□□□□□ -0.21
ESF1Q06344 GBP2YCL011C 1284 nt13.7□□□□□ -0.22
ESF1Q06344 ERV46YAL042W 1248 nt13.66□□□□□ -0.22
ESF1Q06344 YDR433WYDR433W 441 nt13.61□□□□□ -0.23
ESF1Q06344 LPX1YOR084W 1164 nt13.61□□□□□ -0.23
ESF1Q06344 YIL100WYIL100W 354 nt13.57□□□□□ -0.24
ESF1Q06344 RRD1YIL153W 1182 nt13.57□□□□□ -0.24
ESF1Q06344 TCD2YKL027W 1344 nt13.57□□□□□ -0.24
ESF1Q06344 DED1YOR204W 1815 nt13.55□□□□□ -0.24
ESF1Q06344 YKR040CYKR040C 504 nt13.54□□□□□ -0.24
ESF1Q06344 TAT1YBR069C 1860 nt13.53□□□□□ -0.24
ESF1Q06344 MXR2YCL033C 507 nt13.52□□□□□ -0.25
ESF1Q06344 MRPL8YJL063C 717 nt13.49□□□□□ -0.25
ESF1Q06344 YSC84YHR016C 1407 nt13.41□□□□□ -0.26
ESF1Q06344 FMP52YER004W 696 nt13.41□□□□□ -0.26
ESF1Q06344 FMT1YBL013W 1206 nt13.41□□□□□ -0.26
ESF1Q06344 YNL195CYNL195C 786 nt13.4□□□□□ -0.26
ESF1Q06344 RRT12YCR045C 1476 nt13.39□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 YHL050CYHL050C 2094 nt13.38□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 SEC11YIR022W 504 nt13.38□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 FRD1YEL047C 1413 nt13.34□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 SOR2YDL246C 1074 nt13.34□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 SOR1YJR159W 1074 nt13.34□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 SPP1YPL138C 1062 nt13.34□□□□□ -0.27
ESF1Q06344 ADO1YJR105W 1023 nt13.3□□□□□ -0.28
ESF1Q06344 YCL042WYCL042W 360 nt13.29□□□□□ -0.28
ESF1Q06344 PCH2YBR186W 1695 nt13.28□□□□□ -0.28
ESF1Q06344 CWP1YKL096W 720 nt13.24□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 ADH2YMR303C 1047 nt13.23□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 PCM1YEL058W 1674 nt13.23□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.22□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 YEL076CYEL076C 651 nt13.22□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 YLR464WYLR464W 651 nt13.22□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 GUT2YIL155C 1950 nt13.21□□□□□ -0.29
ESF1Q06344 RTG1YOL067C 534 nt13.14□□□□□ -0.31
ESF1Q06344 SNF6YHL025W 999 nt13.13□□□□□ -0.31
ESF1Q06344 PIB2YGL023C 1908 nt13.06□□□□□ -0.32
ESF1Q06344 LCB1YMR296C 1677 nt13.05□□□□□ -0.32
ESF1Q06344 NCP1YHR042W 2076 nt13.05□□□□□ -0.32
ESF1Q06344 PTH1YHR189W 573 nt13.05□□□□□ -0.32
ESF1Q06344 YIH1YCR059C 777 nt13.04□□□□□ -0.32
ESF1Q06344 YLR235CYLR235C 399 nt13.04□□□□□ -0.32
ESF1Q06344 RNQ1YCL028W 1218 nt13.02□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 SIM1YIL123W 1431 nt13.01□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 RTF1YGL244W 1677 nt13□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 UBX6YJL048C 1191 nt13□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 BIO4YNR057C 714 nt13□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 DIC1YLR348C 897 nt12.99□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 BOP3YNL042W 1191 nt12.99□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 YKL030WYKL030W 606 nt12.96□□□□□ -0.33
ESF1Q06344 HUA1YGR268C 597 nt12.94□□□□□ -0.34
ESF1Q06344 YLL053CYLL053C 459 nt12.91□□□□□ -0.34
ESF1Q06344 TIM23YNR017W 669 nt12.89□□□□□ -0.35
ESF1Q06344 YJL225CYJL225C 5277 nt12.84□□□□□ -0.35
ESF1Q06344 PTK1YKL198C 1989 nt12.83□□□□□ -0.35
ESF1Q06344 FTR1YER145C 1215 nt12.83□□□□□ -0.36
ESF1Q06344 YDR094WYDR094W 336 nt12.82□□□□□ -0.36
ESF1Q06344 LYS4YDR234W 2082 nt12.81□□□□□ -0.36
ESF1Q06344 YLR179CYLR179C 606 nt12.81□□□□□ -0.36
ESF1Q06344 ERF2YLR246W 1080 nt12.81□□□□□ -0.36
ESF1Q06344 GAL1YBR020W 1587 nt12.78□□□□□ -0.36
ESF1Q06344 CRR1YLR213C 1269 nt12.77□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 AQY1YPR192W 918 nt12.77□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 ATF2YGR177C 1608 nt12.75□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 AHT1YHR093W 549 nt12.75□□□□□ -0.37
ESF1Q06344 TRM5YHR070W 1500 nt12.74□□□□□ -0.37
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