Protein–RNA interactions for Protein: Q06102

YTH1, mRNA 3'-end-processing protein YTH1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YTH1Q06102 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt10.42□□□□□ -0.74
YTH1Q06102 SIS1YNL007C 1059 nt10.41□□□□□ -0.74
YTH1Q06102 PTP1YDL230W 1008 nt10.38□□□□□ -0.75
YTH1Q06102 DSK2YMR276W 1122 nt10.38□□□□□ -0.75
YTH1Q06102 YPR011CYPR011C 981 nt10.37□□□□□ -0.75
YTH1Q06102 IMP2'YIL154C 1041 nt10.35□□□□□ -0.75
YTH1Q06102 YJL152WYJL152W 360 nt10.33□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 YLR236CYLR236C 324 nt10.33□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 RPP2AYOL039W 321 nt10.33□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 MOT3YMR070W 1473 nt10.33□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 PAC11YDR488C 1602 nt10.32□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 TIR4YOR009W 1464 nt10.31□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 DCW1YKL046C 1350 nt10.31□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 YCH1YGR203W 447 nt10.31□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 FMP45YDL222C 930 nt10.3□□□□□ -0.76
YTH1Q06102 NVJ2YPR091C 2313 nt10.27□□□□□ -0.77
YTH1Q06102 FPS1YLL043W 2010 nt10.26□□□□□ -0.77
YTH1Q06102 CAC2YML102W 1407 nt10.25□□□□□ -0.77
YTH1Q06102 ART5YGR068C 1761 nt10.25□□□□□ -0.77
YTH1Q06102 GFD2YCL036W 1701 nt10.23□□□□□ -0.77
YTH1Q06102 IDH1YNL037C 1083 nt10.2□□□□□ -0.78
YTH1Q06102 PET9YBL030C 957 nt10.17□□□□□ -0.78
YTH1Q06102 LPX1YOR084W 1164 nt10.15□□□□□ -0.78
YTH1Q06102 SSA4YER103W 1929 nt10.15□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 EMI2YDR516C 1503 nt10.14□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 ERV46YAL042W 1248 nt10.14□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 YMR057CYMR057C 372 nt10.14□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 YDR433WYDR433W 441 nt10.11□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 IRC15YPL017C 1500 nt10.11□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 YDL221WYDL221W 552 nt10.1□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 GBP2YCL011C 1284 nt10.1□□□□□ -0.79
YTH1Q06102 RTS2YOR077W 699 nt10.07□□□□□ -0.8
YTH1Q06102 YKR040CYKR040C 504 nt10.06□□□□□ -0.8
YTH1Q06102 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.06□□□□□ -0.8
YTH1Q06102 SPP1YPL138C 1062 nt10.03□□□□□ -0.8
YTH1Q06102 MXR2YCL033C 507 nt10.01□□□□□ -0.81
YTH1Q06102 GIS3YLR094C 1509 nt10.01□□□□□ -0.81
YTH1Q06102 MRPL8YJL063C 717 nt9.98□□□□□ -0.81
YTH1Q06102 YBR220CYBR220C 1683 nt9.96□□□□□ -0.81
YTH1Q06102 CUE1YMR264W 612 nt9.96□□□□□ -0.82
YTH1Q06102 TCD2YKL027W 1344 nt9.96□□□□□ -0.82
YTH1Q06102 DED1YOR204W 1815 nt9.96□□□□□ -0.82
YTH1Q06102 SDH1YKL148C 1923 nt9.95□□□□□ -0.82
YTH1Q06102 RRD1YIL153W 1182 nt9.95□□□□□ -0.82
YTH1Q06102 YMR090WYMR090W 684 nt9.95□□□□□ -0.82
YTH1Q06102 SCC4YER147C 1875 nt9.89□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 RTG1YOL067C 534 nt9.88□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt9.87□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 YEL076CYEL076C 651 nt9.87□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 YLR464WYLR464W 651 nt9.87□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 ADO1YJR105W 1023 nt9.85□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 FMT1YBL013W 1206 nt9.85□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 FRD1YEL047C 1413 nt9.84□□□□□ -0.83
YTH1Q06102 BDF1YLR399C 2061 nt9.79□□□□□ -0.84
YTH1Q06102 SOR2YDL246C 1074 nt9.78□□□□□ -0.84
YTH1Q06102 YIL100WYIL100W 354 nt9.78□□□□□ -0.84
YTH1Q06102 SOR1YJR159W 1074 nt9.78□□□□□ -0.84
YTH1Q06102 YCL042WYCL042W 360 nt9.77□□□□□ -0.85
YTH1Q06102 FMP52YER004W 696 nt9.73□□□□□ -0.85
YTH1Q06102 HUA1YGR268C 597 nt9.7□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 PTH1YHR189W 573 nt9.69□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 CWP1YKL096W 720 nt9.68□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 ADH2YMR303C 1047 nt9.67□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 YHL050CYHL050C 2094 nt9.67□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 YLR235CYLR235C 399 nt9.66□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 TAT1YBR069C 1860 nt9.66□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 RRT12YCR045C 1476 nt9.66□□□□□ -0.86
YTH1Q06102 YSC84YHR016C 1407 nt9.65□□□□□ -0.87
YTH1Q06102 YKL030WYKL030W 606 nt9.64□□□□□ -0.87
YTH1Q06102 UBX6YJL048C 1191 nt9.63□□□□□ -0.87
YTH1Q06102 PCM1YEL058W 1674 nt9.61□□□□□ -0.87
YTH1Q06102 LCB1YMR296C 1677 nt9.59□□□□□ -0.87
YTH1Q06102 YNL195CYNL195C 786 nt9.59□□□□□ -0.87
YTH1Q06102 SNF6YHL025W 999 nt9.57□□□□□ -0.88
YTH1Q06102 DIC1YLR348C 897 nt9.53□□□□□ -0.88
YTH1Q06102 YDR094WYDR094W 336 nt9.52□□□□□ -0.89
YTH1Q06102 TIM23YNR017W 669 nt9.51□□□□□ -0.89
YTH1Q06102 YIH1YCR059C 777 nt9.5□□□□□ -0.89
YTH1Q06102 SEC11YIR022W 504 nt9.5□□□□□ -0.89
YTH1Q06102 RNQ1YCL028W 1218 nt9.5□□□□□ -0.89
YTH1Q06102 PCH2YBR186W 1695 nt9.48□□□□□ -0.89
YTH1Q06102 BIO4YNR057C 714 nt9.46□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 YLR179CYLR179C 606 nt9.45□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 GUT2YIL155C 1950 nt9.44□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 NCP1YHR042W 2076 nt9.43□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 PIB2YGL023C 1908 nt9.42□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 SIM1YIL123W 1431 nt9.41□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.4□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 YLL053CYLL053C 459 nt9.4□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 YPR064WYPR064W 420 nt9.4□□□□□ -0.9
YTH1Q06102 WSC2YNL283C 1512 nt9.39□□□□□ -0.91
YTH1Q06102 UME6YDR207C 2511 nt9.38□□□□□ -0.91
YTH1Q06102 AHT1YHR093W 549 nt9.37□□□□□ -0.91
YTH1Q06102 TAD3YLR316C 969 nt9.36□□□□□ -0.91
YTH1Q06102 FTR1YER145C 1215 nt9.34□□□□□ -0.91
YTH1Q06102 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.33□□□□□ -0.92
YTH1Q06102 GAL1YBR020W 1587 nt9.33□□□□□ -0.92
YTH1Q06102 YFR018CYFR018C 1092 nt9.32□□□□□ -0.92
YTH1Q06102 AQY1YPR192W 918 nt9.31□□□□□ -0.92
YTH1Q06102 LYS4YDR234W 2082 nt9.3□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.7 ms