Protein–RNA interactions for Protein: Q05928

Btc, Probetacellulin, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BtcQ05928 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BtcQ05928 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtcQ05928 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtcQ05928 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BtcQ05928 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
BtcQ05928 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BtcQ05928 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BtcQ05928 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
BtcQ05928 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
BtcQ05928 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BtcQ05928 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BtcQ05928 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BtcQ05928 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BtcQ05928 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtcQ05928 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtcQ05928 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BtcQ05928 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BtcQ05928 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BtcQ05928 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BtcQ05928 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
BtcQ05928 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
BtcQ05928 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
BtcQ05928 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BtcQ05928 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BtcQ05928 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BtcQ05928 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BtcQ05928 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BtcQ05928 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
BtcQ05928 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
BtcQ05928 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
BtcQ05928 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
BtcQ05928 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
BtcQ05928 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BtcQ05928 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BtcQ05928 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BtcQ05928 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BtcQ05928 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BtcQ05928 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BtcQ05928 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
BtcQ05928 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
BtcQ05928 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
BtcQ05928 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
BtcQ05928 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms