Protein–RNA interactions for Protein: Q05899

YLR297W, Uncharacterized vacuolar protein YLR297W, yeastyeast

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR297WQ05899 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.2□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 YLR281CYLR281C 468 nt13.19□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 WHI5YOR083W 888 nt13.18□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 TIR4YOR009W 1464 nt13.16□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 YMR090WYMR090W 684 nt13.16□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 GFD2YCL036W 1701 nt13.16□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 YDL221WYDL221W 552 nt13.15□□□□□ -0.3
YLR297WQ05899 YJL152WYJL152W 360 nt13.13□□□□□ -0.31
YLR297WQ05899 PET9YBL030C 957 nt13.12□□□□□ -0.31
YLR297WQ05899 YCH1YGR203W 447 nt13.08□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 IRC15YPL017C 1500 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 YMR057CYMR057C 372 nt13.05□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 PUS2YGL063W 1113 nt13.04□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 YBR220CYBR220C 1683 nt13.03□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 RTS2YOR077W 699 nt13.03□□□□□ -0.32
YLR297WQ05899 SDH1YKL148C 1923 nt13□□□□□ -0.33
YLR297WQ05899 GIS3YLR094C 1509 nt12.98□□□□□ -0.33
YLR297WQ05899 SCC4YER147C 1875 nt12.93□□□□□ -0.34
YLR297WQ05899 BDF1YLR399C 2061 nt12.89□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 CUE1YMR264W 612 nt12.88□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.88□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 DSK2YMR276W 1122 nt12.87□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 FPS1YLL043W 2010 nt12.86□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 IMP2'YIL154C 1041 nt12.84□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 YLR236CYLR236C 324 nt12.84□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 IDH1YNL037C 1083 nt12.84□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 YPR011CYPR011C 981 nt12.84□□□□□ -0.35
YLR297WQ05899 GBP2YCL011C 1284 nt12.77□□□□□ -0.37
YLR297WQ05899 YIL100WYIL100W 354 nt12.73□□□□□ -0.37
YLR297WQ05899 FMP45YDL222C 930 nt12.71□□□□□ -0.37
YLR297WQ05899 TAT1YBR069C 1860 nt12.71□□□□□ -0.37
YLR297WQ05899 YDR433WYDR433W 441 nt12.68□□□□□ -0.38
YLR297WQ05899 LPX1YOR084W 1164 nt12.64□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 RRD1YIL153W 1182 nt12.63□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 TCD2YKL027W 1344 nt12.62□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 YSC84YHR016C 1407 nt12.62□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 ERV46YAL042W 1248 nt12.61□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 MXR2YCL033C 507 nt12.61□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 RRT12YCR045C 1476 nt12.59□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 DED1YOR204W 1815 nt12.59□□□□□ -0.39
YLR297WQ05899 YNL195CYNL195C 786 nt12.58□□□□□ -0.4
YLR297WQ05899 YHL050CYHL050C 2094 nt12.55□□□□□ -0.4
YLR297WQ05899 SEC11YIR022W 504 nt12.54□□□□□ -0.4
YLR297WQ05899 YKR040CYKR040C 504 nt12.54□□□□□ -0.4
YLR297WQ05899 PCH2YBR186W 1695 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR297WQ05899 MOT3YMR070W 1473 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR297WQ05899 FMT1YBL013W 1206 nt12.49□□□□□ -0.41
YLR297WQ05899 FMP52YER004W 696 nt12.45□□□□□ -0.42
YLR297WQ05899 GUT2YIL155C 1950 nt12.42□□□□□ -0.42
YLR297WQ05899 CWP1YKL096W 720 nt12.38□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 SPP1YPL138C 1062 nt12.38□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 YCL042WYCL042W 360 nt12.38□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 FRD1YEL047C 1413 nt12.37□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 SOR2YDL246C 1074 nt12.36□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 SOR1YJR159W 1074 nt12.36□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 ADH2YMR303C 1047 nt12.36□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 PCM1YEL058W 1674 nt12.35□□□□□ -0.43
YLR297WQ05899 SNF6YHL025W 999 nt12.27□□□□□ -0.45
YLR297WQ05899 PIB2YGL023C 1908 nt12.24□□□□□ -0.45
YLR297WQ05899 RTF1YGL244W 1677 nt12.22□□□□□ -0.45
YLR297WQ05899 LCB1YMR296C 1677 nt12.22□□□□□ -0.45
YLR297WQ05899 SIM1YIL123W 1431 nt12.2□□□□□ -0.46
YLR297WQ05899 BOP3YNL042W 1191 nt12.2□□□□□ -0.46
YLR297WQ05899 NCP1YHR042W 2076 nt12.18□□□□□ -0.46
YLR297WQ05899 PTH1YHR189W 573 nt12.17□□□□□ -0.46
YLR297WQ05899 BIO4YNR057C 714 nt12.15□□□□□ -0.46
YLR297WQ05899 YIH1YCR059C 777 nt12.12□□□□□ -0.47
YLR297WQ05899 RNQ1YCL028W 1218 nt12.11□□□□□ -0.47
YLR297WQ05899 DIC1YLR348C 897 nt12.09□□□□□ -0.47
YLR297WQ05899 YLR235CYLR235C 399 nt12.08□□□□□ -0.48
YLR297WQ05899 YLL053CYLL053C 459 nt12.06□□□□□ -0.48
YLR297WQ05899 RTG1YOL067C 534 nt12.06□□□□□ -0.48
YLR297WQ05899 PTK1YKL198C 1989 nt12.05□□□□□ -0.48
YLR297WQ05899 YKL030WYKL030W 606 nt12□□□□□ -0.49
YLR297WQ05899 TIM23YNR017W 669 nt11.98□□□□□ -0.49
YLR297WQ05899 FTR1YER145C 1215 nt11.96□□□□□ -0.49
YLR297WQ05899 LYS4YDR234W 2082 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 YEL076CYEL076C 651 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 ERF2YLR246W 1080 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 YLR464WYLR464W 651 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 YLR179CYLR179C 606 nt11.94□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 MRPL8YJL063C 717 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 GAL1YBR020W 1587 nt11.92□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 ATF2YGR177C 1608 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 CRR1YLR213C 1269 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 TRM5YHR070W 1500 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR297WQ05899 YFL054CYFL054C 1941 nt11.86□□□□□ -0.51
YLR297WQ05899 YFL067WYFL067W 528 nt11.85□□□□□ -0.51
YLR297WQ05899 ADO1YJR105W 1023 nt11.85□□□□□ -0.51
YLR297WQ05899 HUA1YGR268C 597 nt11.84□□□□□ -0.51
YLR297WQ05899 DDR2YOL052C-A 186 nt11.84□□□□□ -0.51
YLR297WQ05899 PAC11YDR488C 1602 nt11.83□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 AQY1YPR192W 918 nt11.83□□□□□ -0.52
YLR297WQ05899 WSC2YNL283C 1512 nt11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.7 ms