Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Fmn1Q05860 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
Fmn1Q05860 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC47.52■■■■■ 5.2
Fmn1Q05860 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC47.52■■■■■ 5.2
Fmn1Q05860 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Fmn1Q05860 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
Fmn1Q05860 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Fmn1Q05860 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.18
Fmn1Q05860 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
Fmn1Q05860 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.35■■■■■ 5.17
Fmn1Q05860 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Fmn1Q05860 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.3■■■■■ 5.16
Fmn1Q05860 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.3■■■■■ 5.16
Fmn1Q05860 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.26■■■■■ 5.16
Fmn1Q05860 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47.22■■■■■ 5.15
Fmn1Q05860 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC47.17■■■■■ 5.14
Fmn1Q05860 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
Fmn1Q05860 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
Fmn1Q05860 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.1
Fmn1Q05860 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
Fmn1Q05860 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Fmn1Q05860 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Fmn1Q05860 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
Fmn1Q05860 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC46.78■■■■■ 5.08
Fmn1Q05860 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Fmn1Q05860 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
Fmn1Q05860 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC46.65■■■■■ 5.06
Fmn1Q05860 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
Fmn1Q05860 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC46.51■■■■■ 5.04
Fmn1Q05860 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
Fmn1Q05860 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Fmn1Q05860 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC46.41■■■■■ 5.02
Fmn1Q05860 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
Fmn1Q05860 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
Fmn1Q05860 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
Fmn1Q05860 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.32■■■■■ 5.01
Fmn1Q05860 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Fmn1Q05860 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC46.28■■■■■ 5
Fmn1Q05860 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Fmn1Q05860 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Fmn1Q05860 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
Fmn1Q05860 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
Fmn1Q05860 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
Fmn1Q05860 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Fmn1Q05860 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
Fmn1Q05860 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC46.15■■■■■ 4.98
Fmn1Q05860 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
Fmn1Q05860 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
Fmn1Q05860 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
Fmn1Q05860 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
Fmn1Q05860 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Fmn1Q05860 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
Fmn1Q05860 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Fmn1Q05860 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
Fmn1Q05860 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Fmn1Q05860 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.86■■■■■ 4.93
Fmn1Q05860 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
Fmn1Q05860 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC45.77■■■■■ 4.92
Fmn1Q05860 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Fmn1Q05860 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Fmn1Q05860 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Fmn1Q05860 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Fmn1Q05860 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Fmn1Q05860 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
Fmn1Q05860 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC45.62■■■■■ 4.89
Fmn1Q05860 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Fmn1Q05860 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Fmn1Q05860 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Fmn1Q05860 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Fmn1Q05860 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45.49■■■■■ 4.87
Fmn1Q05860 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Fmn1Q05860 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Fmn1Q05860 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Fmn1Q05860 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
Fmn1Q05860 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.32■■■■■ 4.85
Fmn1Q05860 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
Fmn1Q05860 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
Fmn1Q05860 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45.28■■■■■ 4.84
Fmn1Q05860 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Fmn1Q05860 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
Fmn1Q05860 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
Fmn1Q05860 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
Fmn1Q05860 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
Fmn1Q05860 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45.22■■■■■ 4.83
Fmn1Q05860 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Fmn1Q05860 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Fmn1Q05860 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
Fmn1Q05860 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Fmn1Q05860 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
Fmn1Q05860 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Fmn1Q05860 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
Fmn1Q05860 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Fmn1Q05860 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
Fmn1Q05860 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Fmn1Q05860 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
Fmn1Q05860 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC45■■■■■ 4.79
Fmn1Q05860 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Fmn1Q05860 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
Fmn1Q05860 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Fmn1Q05860 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.2 ms