Protein–RNA interactions for Protein: Q05793

Hspg2, Basement membrane-specific heparan sulfate proteoglycan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspg2Q05793 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hspg2Q05793 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hspg2Q05793 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspg2Q05793 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hspg2Q05793 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hspg2Q05793 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hspg2Q05793 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hspg2Q05793 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hspg2Q05793 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hspg2Q05793 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hspg2Q05793 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hspg2Q05793 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hspg2Q05793 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hspg2Q05793 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hspg2Q05793 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hspg2Q05793 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hspg2Q05793 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hspg2Q05793 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hspg2Q05793 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hspg2Q05793 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hspg2Q05793 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hspg2Q05793 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hspg2Q05793 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hspg2Q05793 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hspg2Q05793 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Hspg2Q05793 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Hspg2Q05793 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Hspg2Q05793 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Hspg2Q05793 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Hspg2Q05793 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Hspg2Q05793 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Hspg2Q05793 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Hspg2Q05793 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Hspg2Q05793 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hspg2Q05793 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Hspg2Q05793 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Hspg2Q05793 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Hspg2Q05793 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hspg2Q05793 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hspg2Q05793 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Hspg2Q05793 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hspg2Q05793 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hspg2Q05793 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hspg2Q05793 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hspg2Q05793 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hspg2Q05793 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hspg2Q05793 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hspg2Q05793 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hspg2Q05793 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Hspg2Q05793 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Hspg2Q05793 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Hspg2Q05793 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Hspg2Q05793 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Hspg2Q05793 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Hspg2Q05793 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Hspg2Q05793 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Hspg2Q05793 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hspg2Q05793 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms