Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 IMP2'YIL154C 1041 nt11.73□□□□□ -0.53
RRN11Q04712 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.73□□□□□ -0.53
RRN11Q04712 MEP2YNL142W 1500 nt11.71□□□□□ -0.53
RRN11Q04712 DSK2YMR276W 1122 nt11.69□□□□□ -0.54
RRN11Q04712 YPS1YLR120C 1710 nt11.69□□□□□ -0.54
RRN11Q04712 YDR095CYDR095C 411 nt11.67□□□□□ -0.54
RRN11Q04712 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.66□□□□□ -0.54
RRN11Q04712 YJL152WYJL152W 360 nt11.65□□□□□ -0.54
RRN11Q04712 MOT3YMR070W 1473 nt11.64□□□□□ -0.55
RRN11Q04712 FMP45YDL222C 930 nt11.63□□□□□ -0.55
RRN11Q04712 SIS1YNL007C 1059 nt11.55□□□□□ -0.56
RRN11Q04712 Q0182Q0182 405 nt11.54□□□□□ -0.56
RRN11Q04712 BDF1YLR399C 2061 nt11.53□□□□□ -0.56
RRN11Q04712 IDH1YNL037C 1083 nt11.53□□□□□ -0.56
RRN11Q04712 YCH1YGR203W 447 nt11.52□□□□□ -0.57
RRN11Q04712 YLR236CYLR236C 324 nt11.52□□□□□ -0.57
RRN11Q04712 RPP2AYOL039W 321 nt11.5□□□□□ -0.57
RRN11Q04712 DCW1YKL046C 1350 nt11.49□□□□□ -0.57
RRN11Q04712 YPR011CYPR011C 981 nt11.45□□□□□ -0.58
RRN11Q04712 TIR4YOR009W 1464 nt11.4□□□□□ -0.58
RRN11Q04712 YDR433WYDR433W 441 nt11.39□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 TAT1YBR069C 1860 nt11.38□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.36□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 EMI2YDR516C 1503 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 ERV46YAL042W 1248 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 PET9YBL030C 957 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 YMR090WYMR090W 684 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 GBP2YCL011C 1284 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 UME6YDR207C 2511 nt11.35□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 LPX1YOR084W 1164 nt11.34□□□□□ -0.59
RRN11Q04712 ART5YGR068C 1761 nt11.32□□□□□ -0.6
RRN11Q04712 MRPL8YJL063C 717 nt11.31□□□□□ -0.6
RRN11Q04712 CAC2YML102W 1407 nt11.3□□□□□ -0.6
RRN11Q04712 YBR220CYBR220C 1683 nt11.29□□□□□ -0.6
RRN11Q04712 YKR040CYKR040C 504 nt11.28□□□□□ -0.6
RRN11Q04712 YMR057CYMR057C 372 nt11.28□□□□□ -0.6
RRN11Q04712 PTP1YDL230W 1008 nt11.27□□□□□ -0.61
RRN11Q04712 YDL221WYDL221W 552 nt11.25□□□□□ -0.61
RRN11Q04712 GFD2YCL036W 1701 nt11.24□□□□□ -0.61
RRN11Q04712 ADO1YJR105W 1023 nt11.22□□□□□ -0.61
RRN11Q04712 TCD2YKL027W 1344 nt11.22□□□□□ -0.61
RRN11Q04712 SDH1YKL148C 1923 nt11.19□□□□□ -0.62
RRN11Q04712 MXR2YCL033C 507 nt11.16□□□□□ -0.62
RRN11Q04712 SPP1YPL138C 1062 nt11.14□□□□□ -0.63
RRN11Q04712 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.13□□□□□ -0.63
RRN11Q04712 YEL076CYEL076C 651 nt11.13□□□□□ -0.63
RRN11Q04712 YLR464WYLR464W 651 nt11.13□□□□□ -0.63
RRN11Q04712 RTS2YOR077W 699 nt11.11□□□□□ -0.63
RRN11Q04712 SCC4YER147C 1875 nt11.06□□□□□ -0.64
RRN11Q04712 YCL042WYCL042W 360 nt11.04□□□□□ -0.64
RRN11Q04712 IRC15YPL017C 1500 nt11.04□□□□□ -0.64
RRN11Q04712 CUE1YMR264W 612 nt11.03□□□□□ -0.64
RRN11Q04712 RTG1YOL067C 534 nt11.02□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 RPM1RPM1 483 nt11.01□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 HUA1YGR268C 597 nt11□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 YIL100WYIL100W 354 nt11□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 SEC11YIR022W 504 nt10.99□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 GIS3YLR094C 1509 nt10.98□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 RRD1YIL153W 1182 nt10.97□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 PCH2YBR186W 1695 nt10.97□□□□□ -0.65
RRN11Q04712 FRD1YEL047C 1413 nt10.94□□□□□ -0.66
RRN11Q04712 DED1YOR204W 1815 nt10.94□□□□□ -0.66
RRN11Q04712 FMP52YER004W 696 nt10.92□□□□□ -0.66
RRN11Q04712 YLR235CYLR235C 399 nt10.92□□□□□ -0.66
RRN11Q04712 GUT2YIL155C 1950 nt10.91□□□□□ -0.66
RRN11Q04712 SOR2YDL246C 1074 nt10.89□□□□□ -0.67
RRN11Q04712 SOR1YJR159W 1074 nt10.89□□□□□ -0.67
RRN11Q04712 PTH1YHR189W 573 nt10.87□□□□□ -0.67
RRN11Q04712 YKL030WYKL030W 606 nt10.86□□□□□ -0.67
RRN11Q04712 YSC84YHR016C 1407 nt10.84□□□□□ -0.67
RRN11Q04712 CWP1YKL096W 720 nt10.83□□□□□ -0.68
RRN11Q04712 FMT1YBL013W 1206 nt10.82□□□□□ -0.68
RRN11Q04712 YNL195CYNL195C 786 nt10.81□□□□□ -0.68
RRN11Q04712 UBX6YJL048C 1191 nt10.8□□□□□ -0.68
RRN11Q04712 YHL050CYHL050C 2094 nt10.77□□□□□ -0.69
RRN11Q04712 SNF6YHL025W 999 nt10.74□□□□□ -0.69
RRN11Q04712 ADH2YMR303C 1047 nt10.74□□□□□ -0.69
RRN11Q04712 LCB1YMR296C 1677 nt10.73□□□□□ -0.69
RRN11Q04712 YDR094WYDR094W 336 nt10.73□□□□□ -0.69
RRN11Q04712 PIB2YGL023C 1908 nt10.72□□□□□ -0.69
RRN11Q04712 MCH5YOR306C 1566 nt10.7□□□□□ -0.7
RRN11Q04712 DIC1YLR348C 897 nt10.69□□□□□ -0.7
RRN11Q04712 RRT12YCR045C 1476 nt10.68□□□□□ -0.7
RRN11Q04712 TIM23YNR017W 669 nt10.68□□□□□ -0.7
RRN11Q04712 PCM1YEL058W 1674 nt10.68□□□□□ -0.7
RRN11Q04712 RTF1YGL244W 1677 nt10.67□□□□□ -0.7
RRN11Q04712 BOR1YNL275W 1731 nt10.64□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 YLR179CYLR179C 606 nt10.63□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.62□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 BOP3YNL042W 1191 nt10.61□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 YPR064WYPR064W 420 nt10.61□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 RNQ1YCL028W 1218 nt10.6□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 YJL225CYJL225C 5277 nt10.59□□□□□ -0.71
RRN11Q04712 YIH1YCR059C 777 nt10.57□□□□□ -0.72
RRN11Q04712 RRT5YFR032C 870 nt10.5□□□□□ -0.73
RRN11Q04712 AQY1YPR192W 918 nt10.5□□□□□ -0.73
RRN11Q04712 PTK1YKL198C 1989 nt10.5□□□□□ -0.73
RRN11Q04712 SIM1YIL123W 1431 nt10.5□□□□□ -0.73
RRN11Q04712 TAD3YLR316C 969 nt10.49□□□□□ -0.73
RRN11Q04712 YLL053CYLL053C 459 nt10.46□□□□□ -0.73
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