Protein–RNA interactions for Protein: Q02629

NUP100, Nucleoporin NUP100/NSP100, yeastyeast

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Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP100Q02629 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.34□□□□□ -0.43
NUP100Q02629 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.34□□□□□ -0.43
NUP100Q02629 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.34□□□□□ -0.43
NUP100Q02629 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.34□□□□□ -0.43
NUP100Q02629 SSA4YER103W 1929 nt12.32□□□□□ -0.44
NUP100Q02629 CAC2YML102W 1407 nt12.31□□□□□ -0.44
NUP100Q02629 PUS2YGL063W 1113 nt12.28□□□□□ -0.44
NUP100Q02629 ART5YGR068C 1761 nt12.27□□□□□ -0.45
NUP100Q02629 TIR4YOR009W 1464 nt12.27□□□□□ -0.45
NUP100Q02629 EMI2YDR516C 1503 nt12.26□□□□□ -0.45
NUP100Q02629 YJL152WYJL152W 360 nt12.24□□□□□ -0.45
NUP100Q02629 GFD2YCL036W 1701 nt12.21□□□□□ -0.45
NUP100Q02629 YCH1YGR203W 447 nt12.19□□□□□ -0.46
NUP100Q02629 PET9YBL030C 957 nt12.19□□□□□ -0.46
NUP100Q02629 YDL221WYDL221W 552 nt12.15□□□□□ -0.46
NUP100Q02629 YMR057CYMR057C 372 nt12.14□□□□□ -0.47
NUP100Q02629 YMR090WYMR090W 684 nt12.13□□□□□ -0.47
NUP100Q02629 IRC15YPL017C 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
NUP100Q02629 DSK2YMR276W 1122 nt12.08□□□□□ -0.48
NUP100Q02629 RTS2YOR077W 699 nt12.08□□□□□ -0.48
NUP100Q02629 YPR011CYPR011C 981 nt12.08□□□□□ -0.48
NUP100Q02629 YLR236CYLR236C 324 nt12.07□□□□□ -0.48
NUP100Q02629 IMP2'YIL154C 1041 nt12.05□□□□□ -0.48
NUP100Q02629 YBR220CYBR220C 1683 nt12.01□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 IDH1YNL037C 1083 nt12.01□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 GIS3YLR094C 1509 nt12.01□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 SDH1YKL148C 1923 nt12□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.99□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 FPS1YLL043W 2010 nt11.96□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 FMP45YDL222C 930 nt11.96□□□□□ -0.49
NUP100Q02629 CUE1YMR264W 612 nt11.95□□□□□ -0.5
NUP100Q02629 SCC4YER147C 1875 nt11.94□□□□□ -0.5
NUP100Q02629 GBP2YCL011C 1284 nt11.93□□□□□ -0.5
NUP100Q02629 YDR433WYDR433W 441 nt11.87□□□□□ -0.51
NUP100Q02629 LPX1YOR084W 1164 nt11.87□□□□□ -0.51
NUP100Q02629 ERV46YAL042W 1248 nt11.84□□□□□ -0.51
NUP100Q02629 BDF1YLR399C 2061 nt11.83□□□□□ -0.52
NUP100Q02629 MOT3YMR070W 1473 nt11.83□□□□□ -0.52
NUP100Q02629 YIL100WYIL100W 354 nt11.8□□□□□ -0.52
NUP100Q02629 MXR2YCL033C 507 nt11.8□□□□□ -0.52
NUP100Q02629 TCD2YKL027W 1344 nt11.79□□□□□ -0.52
NUP100Q02629 RRD1YIL153W 1182 nt11.78□□□□□ -0.52
NUP100Q02629 YKR040CYKR040C 504 nt11.76□□□□□ -0.53
NUP100Q02629 DED1YOR204W 1815 nt11.76□□□□□ -0.53
NUP100Q02629 TAT1YBR069C 1860 nt11.67□□□□□ -0.54
NUP100Q02629 FMT1YBL013W 1206 nt11.66□□□□□ -0.54
NUP100Q02629 SPP1YPL138C 1062 nt11.66□□□□□ -0.54
NUP100Q02629 YSC84YHR016C 1407 nt11.65□□□□□ -0.54
NUP100Q02629 RRT12YCR045C 1476 nt11.64□□□□□ -0.55
NUP100Q02629 YNL195CYNL195C 786 nt11.63□□□□□ -0.55
NUP100Q02629 FRD1YEL047C 1413 nt11.6□□□□□ -0.55
NUP100Q02629 YHL050CYHL050C 2094 nt11.59□□□□□ -0.55
NUP100Q02629 FMP52YER004W 696 nt11.59□□□□□ -0.55
NUP100Q02629 SOR2YDL246C 1074 nt11.55□□□□□ -0.56
NUP100Q02629 SEC11YIR022W 504 nt11.55□□□□□ -0.56
NUP100Q02629 SOR1YJR159W 1074 nt11.55□□□□□ -0.56
NUP100Q02629 YCL042WYCL042W 360 nt11.55□□□□□ -0.56
NUP100Q02629 CWP1YKL096W 720 nt11.53□□□□□ -0.56
NUP100Q02629 ADH2YMR303C 1047 nt11.52□□□□□ -0.57
NUP100Q02629 PCM1YEL058W 1674 nt11.49□□□□□ -0.57
NUP100Q02629 PCH2YBR186W 1695 nt11.49□□□□□ -0.57
NUP100Q02629 GUT2YIL155C 1950 nt11.43□□□□□ -0.58
NUP100Q02629 SNF6YHL025W 999 nt11.42□□□□□ -0.58
NUP100Q02629 PTH1YHR189W 573 nt11.4□□□□□ -0.58
NUP100Q02629 RTG1YOL067C 534 nt11.39□□□□□ -0.59
NUP100Q02629 LCB1YMR296C 1677 nt11.33□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 MRPL8YJL063C 717 nt11.32□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 YLR235CYLR235C 399 nt11.32□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 YIH1YCR059C 777 nt11.31□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 SIM1YIL123W 1431 nt11.31□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 DIC1YLR348C 897 nt11.3□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 BIO4YNR057C 714 nt11.3□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.29□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 YEL076CYEL076C 651 nt11.29□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 YLR464WYLR464W 651 nt11.29□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 RNQ1YCL028W 1218 nt11.29□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 PIB2YGL023C 1908 nt11.27□□□□□ -0.6
NUP100Q02629 NCP1YHR042W 2076 nt11.27□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 YKL030WYKL030W 606 nt11.26□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 RTF1YGL244W 1677 nt11.25□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 BOP3YNL042W 1191 nt11.24□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 ADO1YJR105W 1023 nt11.23□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 YLL053CYLL053C 459 nt11.22□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 TIM23YNR017W 669 nt11.21□□□□□ -0.61
NUP100Q02629 HUA1YGR268C 597 nt11.16□□□□□ -0.62
NUP100Q02629 YLR179CYLR179C 606 nt11.14□□□□□ -0.63
NUP100Q02629 FTR1YER145C 1215 nt11.13□□□□□ -0.63
NUP100Q02629 ERF2YLR246W 1080 nt11.1□□□□□ -0.63
NUP100Q02629 GAL1YBR020W 1587 nt11.1□□□□□ -0.63
NUP100Q02629 PTK1YKL198C 1989 nt11.09□□□□□ -0.63
NUP100Q02629 TRM5YHR070W 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
NUP100Q02629 ATF2YGR177C 1608 nt11.08□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 LYS4YDR234W 2082 nt11.08□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 WSC2YNL283C 1512 nt11.06□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 CRR1YLR213C 1269 nt11.05□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 AHT1YHR093W 549 nt11.04□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 YPR064WYPR064W 420 nt11.03□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 AQY1YPR192W 918 nt11.03□□□□□ -0.64
NUP100Q02629 YFL067WYFL067W 528 nt11.01□□□□□ -0.65
NUP100Q02629 DDR2YOL052C-A 186 nt11.01□□□□□ -0.65
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