Protein–RNA interactions for Protein: Q02203

YKR005C, Uncharacterized protein YKR005C, yeastyeast

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR005CQ02203 ALF1YNL148C 765 nt11.43□□□□□ -0.58
YKR005CQ02203 FUN26YAL022C 1554 nt11.41□□□□□ -0.58
YKR005CQ02203 RRT12YCR045C 1476 nt11.38□□□□□ -0.59
YKR005CQ02203 SIS1YNL007C 1059 nt11.29□□□□□ -0.6
YKR005CQ02203 RTS2YOR077W 699 nt11.29□□□□□ -0.6
YKR005CQ02203 GFD2YCL036W 1701 nt11.27□□□□□ -0.61
YKR005CQ02203 MCH5YOR306C 1566 nt11.27□□□□□ -0.61
YKR005CQ02203 BDH2YAL061W 1254 nt11.24□□□□□ -0.61
YKR005CQ02203 SRB2YHR041C 633 nt11.23□□□□□ -0.61
YKR005CQ02203 ART5YGR068C 1761 nt11.22□□□□□ -0.61
YKR005CQ02203 YFL054CYFL054C 1941 nt11.21□□□□□ -0.62
YKR005CQ02203 YNL195CYNL195C 786 nt11.2□□□□□ -0.62
YKR005CQ02203 TRM9YML014W 840 nt11.19□□□□□ -0.62
YKR005CQ02203 SPT8YLR055C 1809 nt11.19□□□□□ -0.62
YKR005CQ02203 NCP1YHR042W 2076 nt11.16□□□□□ -0.62
YKR005CQ02203 CUE1YMR264W 612 nt11.15□□□□□ -0.62
YKR005CQ02203 CCT6YDR188W 1641 nt11.14□□□□□ -0.63
YKR005CQ02203 SHU1YHL006C 453 nt11.12□□□□□ -0.63
YKR005CQ02203 ALG12YNR030W 1656 nt11.11□□□□□ -0.63
YKR005CQ02203 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.1□□□□□ -0.63
YKR005CQ02203 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.1□□□□□ -0.63
YKR005CQ02203 HSP60YLR259C 1719 nt11.09□□□□□ -0.63
YKR005CQ02203 WWM1YFL010C 636 nt11.08□□□□□ -0.64
YKR005CQ02203 PET9YBL030C 957 nt11.06□□□□□ -0.64
YKR005CQ02203 YKL097CYKL097C 411 nt11.05□□□□□ -0.64
YKR005CQ02203 YGR021WYGR021W 873 nt11.03□□□□□ -0.64
YKR005CQ02203 YIL100WYIL100W 354 nt11.02□□□□□ -0.65
YKR005CQ02203 LSM3YLR438C-A 270 nt11□□□□□ -0.65
YKR005CQ02203 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt10.97□□□□□ -0.65
YKR005CQ02203 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt10.95□□□□□ -0.66
YKR005CQ02203 HOM6YJR139C 1080 nt10.94□□□□□ -0.66
YKR005CQ02203 YJL225CYJL225C 5277 nt10.94□□□□□ -0.66
YKR005CQ02203 SWE1YJL187C 2460 nt10.92□□□□□ -0.66
YKR005CQ02203 YCH1YGR203W 447 nt10.89□□□□□ -0.67
YKR005CQ02203 GLK1YCL040W 1503 nt10.87□□□□□ -0.67
YKR005CQ02203 TIR4YOR009W 1464 nt10.82□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 MNP1YGL068W 585 nt10.82□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 YLR236CYLR236C 324 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 YMR057CYMR057C 372 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 LCB1YMR296C 1677 nt10.81□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 NAR1YNL240C 1476 nt10.8□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 RKM5YLR137W 1104 nt10.78□□□□□ -0.68
YKR005CQ02203 DSK2YMR276W 1122 nt10.7□□□□□ -0.7
YKR005CQ02203 FUR4YBR021W 1902 nt10.67□□□□□ -0.7
YKR005CQ02203 YOL037CYOL037C 354 nt10.65□□□□□ -0.7
YKR005CQ02203 AAC1YMR056C 930 nt10.64□□□□□ -0.71
YKR005CQ02203 PRP4YPR178W 1398 nt10.6□□□□□ -0.71
YKR005CQ02203 LYS4YDR234W 2082 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR005CQ02203 NPL3YDR432W 1245 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR005CQ02203 YOR139CYOR139C 393 nt10.59□□□□□ -0.71
YKR005CQ02203 BIO4YNR057C 714 nt10.56□□□□□ -0.72
YKR005CQ02203 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.55□□□□□ -0.72
YKR005CQ02203 YEL076CYEL076C 651 nt10.55□□□□□ -0.72
YKR005CQ02203 YLR464WYLR464W 651 nt10.55□□□□□ -0.72
YKR005CQ02203 DPS1YLL018C 1674 nt10.54□□□□□ -0.72
YKR005CQ02203 BIO5YNR056C 1686 nt10.53□□□□□ -0.72
YKR005CQ02203 PBP1YGR178C 2169 nt10.51□□□□□ -0.73
YKR005CQ02203 CMP2YML057W 1815 nt10.51□□□□□ -0.73
YKR005CQ02203 CYT2YKL087C 675 nt10.49□□□□□ -0.73
YKR005CQ02203 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.46□□□□□ -0.73
YKR005CQ02203 SIM1YIL123W 1431 nt10.45□□□□□ -0.74
YKR005CQ02203 HSL7YBR133C 2484 nt10.45□□□□□ -0.74
YKR005CQ02203 SNF1YDR477W 1902 nt10.43□□□□□ -0.74
YKR005CQ02203 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.42□□□□□ -0.74
YKR005CQ02203 BMT6YLR063W 1098 nt10.41□□□□□ -0.74
YKR005CQ02203 YJL152WYJL152W 360 nt10.39□□□□□ -0.75
YKR005CQ02203 YLR281CYLR281C 468 nt10.38□□□□□ -0.75
YKR005CQ02203 WHI5YOR083W 888 nt10.37□□□□□ -0.75
YKR005CQ02203 CCA1YER168C 1641 nt10.34□□□□□ -0.75
YKR005CQ02203 YKR005CYKR005C 1578 nt10.33□□□□□ -0.76
YKR005CQ02203 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.3□□□□□ -0.76
YKR005CQ02203 PCM1YEL058W 1674 nt10.26□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 DED1YOR204W 1815 nt10.25□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 YAT1YAR035W 2064 nt10.24□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.22□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 PUS2YGL063W 1113 nt10.22□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 IMP2'YIL154C 1041 nt10.21□□□□□ -0.77
YKR005CQ02203 HEL2YDR266C 1920 nt10.21□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 IRC24YIR036C 792 nt10.2□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 IDH1YNL037C 1083 nt10.2□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 FMP52YER004W 696 nt10.19□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 NDI1YML120C 1542 nt10.18□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 RAX1YOR301W 1308 nt10.18□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 CRR1YLR213C 1269 nt10.18□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 YGR259CYGR259C 441 nt10.17□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 RRD1YIL153W 1182 nt10.17□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 ERF2YLR246W 1080 nt10.17□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 WSC2YNL283C 1512 nt10.16□□□□□ -0.78
YKR005CQ02203 GBP2YCL011C 1284 nt10.11□□□□□ -0.79
YKR005CQ02203 MIC10YCL057C-A 294 nt10.1□□□□□ -0.79
YKR005CQ02203 HEM12YDR047W 1089 nt10.08□□□□□ -0.8
YKR005CQ02203 SNF6YHL025W 999 nt10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.5 ms