Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Col1a2Q01149 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Col1a2Q01149 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Col1a2Q01149 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Col1a2Q01149 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Col1a2Q01149 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Col1a2Q01149 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Col1a2Q01149 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Col1a2Q01149 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Col1a2Q01149 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Col1a2Q01149 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Col1a2Q01149 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Col1a2Q01149 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Col1a2Q01149 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Col1a2Q01149 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Col1a2Q01149 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Col1a2Q01149 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Col1a2Q01149 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Col1a2Q01149 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Col1a2Q01149 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Col1a2Q01149 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Col1a2Q01149 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Col1a2Q01149 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Col1a2Q01149 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Col1a2Q01149 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Col1a2Q01149 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Col1a2Q01149 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Col1a2Q01149 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Col1a2Q01149 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Col1a2Q01149 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Col1a2Q01149 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Col1a2Q01149 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Col1a2Q01149 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Col1a2Q01149 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Col1a2Q01149 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Col1a2Q01149 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Col1a2Q01149 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.99■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Col1a2Q01149 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Col1a2Q01149 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col1a2Q01149 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Col1a2Q01149 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Col1a2Q01149 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Col1a2Q01149 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Col1a2Q01149 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Col1a2Q01149 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Col1a2Q01149 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Col1a2Q01149 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col1a2Q01149 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col1a2Q01149 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
Col1a2Q01149 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Col1a2Q01149 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col1a2Q01149 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Col1a2Q01149 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Col1a2Q01149 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col1a2Q01149 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Col1a2Q01149 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col1a2Q01149 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col1a2Q01149 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col1a2Q01149 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Col1a2Q01149 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Col1a2Q01149 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Col1a2Q01149 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Col1a2Q01149 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Col1a2Q01149 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Col1a2Q01149 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Col1a2Q01149 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Col1a2Q01149 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Col1a2Q01149 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Col1a2Q01149 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Col1a2Q01149 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Col1a2Q01149 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Col1a2Q01149 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Col1a2Q01149 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Col1a2Q01149 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Col1a2Q01149 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Col1a2Q01149 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Col1a2Q01149 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Col1a2Q01149 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Col1a2Q01149 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Col1a2Q01149 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Col1a2Q01149 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Col1a2Q01149 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col1a2Q01149 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Col1a2Q01149 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms