Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Grin2cQ01098 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Grin2cQ01098 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Grin2cQ01098 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Grin2cQ01098 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Grin2cQ01098 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Grin2cQ01098 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Grin2cQ01098 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2cQ01098 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Grin2cQ01098 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Grin2cQ01098 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Grin2cQ01098 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Grin2cQ01098 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Grin2cQ01098 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2cQ01098 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Grin2cQ01098 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Grin2cQ01098 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Grin2cQ01098 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Grin2cQ01098 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Grin2cQ01098 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2cQ01098 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Grin2cQ01098 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2cQ01098 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Grin2cQ01098 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2cQ01098 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Grin2cQ01098 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Grin2cQ01098 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Grin2cQ01098 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Grin2cQ01098 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Grin2cQ01098 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Grin2cQ01098 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Grin2cQ01098 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2cQ01098 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2cQ01098 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Grin2cQ01098 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Grin2cQ01098 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2cQ01098 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Grin2cQ01098 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Grin2cQ01098 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Grin2cQ01098 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Grin2cQ01098 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Grin2cQ01098 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grin2cQ01098 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Grin2cQ01098 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Grin2cQ01098 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Grin2cQ01098 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Grin2cQ01098 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Grin2cQ01098 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Grin2cQ01098 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Grin2cQ01098 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2cQ01098 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Grin2cQ01098 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Grin2cQ01098 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Grin2cQ01098 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Grin2cQ01098 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Grin2cQ01098 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Grin2cQ01098 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2cQ01098 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Grin2cQ01098 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Grin2cQ01098 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Grin2cQ01098 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2cQ01098 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Grin2cQ01098 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Grin2cQ01098 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms