Protein–RNA interactions for Protein: Q01063

Pde4d, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4dQ01063 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Pde4dQ01063 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Pde4dQ01063 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Pde4dQ01063 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Pde4dQ01063 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Pde4dQ01063 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Pde4dQ01063 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
Pde4dQ01063 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Pde4dQ01063 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Pde4dQ01063 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Pde4dQ01063 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Pde4dQ01063 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Pde4dQ01063 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Pde4dQ01063 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Pde4dQ01063 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Pde4dQ01063 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Pde4dQ01063 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pde4dQ01063 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Pde4dQ01063 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Pde4dQ01063 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pde4dQ01063 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Pde4dQ01063 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Pde4dQ01063 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Pde4dQ01063 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Pde4dQ01063 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Pde4dQ01063 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Pde4dQ01063 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Pde4dQ01063 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Pde4dQ01063 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Pde4dQ01063 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Pde4dQ01063 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Pde4dQ01063 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Pde4dQ01063 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Pde4dQ01063 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Pde4dQ01063 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Pde4dQ01063 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Pde4dQ01063 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Pde4dQ01063 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Pde4dQ01063 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
Pde4dQ01063 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Pde4dQ01063 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Pde4dQ01063 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Pde4dQ01063 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Pde4dQ01063 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Pde4dQ01063 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Pde4dQ01063 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Pde4dQ01063 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Pde4dQ01063 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Pde4dQ01063 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms