Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tcf7Q00417 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tcf7Q00417 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf7Q00417 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf7Q00417 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tcf7Q00417 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tcf7Q00417 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tcf7Q00417 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tcf7Q00417 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tcf7Q00417 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf7Q00417 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tcf7Q00417 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tcf7Q00417 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tcf7Q00417 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcf7Q00417 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf7Q00417 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcf7Q00417 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf7Q00417 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcf7Q00417 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcf7Q00417 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tcf7Q00417 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tcf7Q00417 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tcf7Q00417 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tcf7Q00417 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf7Q00417 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf7Q00417 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf7Q00417 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tcf7Q00417 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tcf7Q00417 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tcf7Q00417 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tcf7Q00417 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tcf7Q00417 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tcf7Q00417 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tcf7Q00417 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tcf7Q00417 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf7Q00417 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tcf7Q00417 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tcf7Q00417 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tcf7Q00417 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tcf7Q00417 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tcf7Q00417 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tcf7Q00417 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tcf7Q00417 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tcf7Q00417 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tcf7Q00417 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tcf7Q00417 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf7Q00417 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tcf7Q00417 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tcf7Q00417 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tcf7Q00417 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tcf7Q00417 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf7Q00417 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tcf7Q00417 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf7Q00417 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tcf7Q00417 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf7Q00417 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tcf7Q00417 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tcf7Q00417 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf7Q00417 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tcf7Q00417 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tcf7Q00417 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms