Protein–RNA interactions for Protein: P82343

Renbp, N-acylglucosamine 2-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RenbpP82343 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
RenbpP82343 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RenbpP82343 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
RenbpP82343 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
RenbpP82343 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RenbpP82343 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RenbpP82343 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
RenbpP82343 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
RenbpP82343 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
RenbpP82343 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RenbpP82343 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RenbpP82343 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RenbpP82343 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RenbpP82343 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RenbpP82343 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RenbpP82343 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RenbpP82343 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
RenbpP82343 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
RenbpP82343 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
RenbpP82343 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RenbpP82343 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
RenbpP82343 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
RenbpP82343 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
RenbpP82343 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
RenbpP82343 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
RenbpP82343 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
RenbpP82343 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
RenbpP82343 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
RenbpP82343 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RenbpP82343 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RenbpP82343 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RenbpP82343 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RenbpP82343 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
RenbpP82343 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
RenbpP82343 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
RenbpP82343 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RenbpP82343 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RenbpP82343 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
RenbpP82343 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
RenbpP82343 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
RenbpP82343 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RenbpP82343 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
RenbpP82343 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
RenbpP82343 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RenbpP82343 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RenbpP82343 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RenbpP82343 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RenbpP82343 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RenbpP82343 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RenbpP82343 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RenbpP82343 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RenbpP82343 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RenbpP82343 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
RenbpP82343 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RenbpP82343 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RenbpP82343 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RenbpP82343 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RenbpP82343 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
RenbpP82343 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RenbpP82343 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RenbpP82343 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RenbpP82343 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
RenbpP82343 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RenbpP82343 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RenbpP82343 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
RenbpP82343 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RenbpP82343 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RenbpP82343 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RenbpP82343 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RenbpP82343 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RenbpP82343 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RenbpP82343 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RenbpP82343 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RenbpP82343 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RenbpP82343 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RenbpP82343 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RenbpP82343 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RenbpP82343 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RenbpP82343 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RenbpP82343 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
RenbpP82343 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RenbpP82343 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RenbpP82343 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RenbpP82343 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RenbpP82343 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RenbpP82343 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RenbpP82343 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
RenbpP82343 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RenbpP82343 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RenbpP82343 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
RenbpP82343 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RenbpP82343 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms