Protein–RNA interactions for Protein: P70670

Naca, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NacaP70670 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NacaP70670 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NacaP70670 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NacaP70670 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NacaP70670 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NacaP70670 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NacaP70670 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NacaP70670 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NacaP70670 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NacaP70670 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NacaP70670 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NacaP70670 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NacaP70670 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NacaP70670 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NacaP70670 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NacaP70670 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NacaP70670 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NacaP70670 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NacaP70670 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NacaP70670 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NacaP70670 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NacaP70670 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NacaP70670 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NacaP70670 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NacaP70670 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NacaP70670 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NacaP70670 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NacaP70670 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NacaP70670 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NacaP70670 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NacaP70670 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NacaP70670 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NacaP70670 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NacaP70670 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NacaP70670 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NacaP70670 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NacaP70670 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NacaP70670 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NacaP70670 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NacaP70670 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NacaP70670 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NacaP70670 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacaP70670 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NacaP70670 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NacaP70670 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NacaP70670 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NacaP70670 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NacaP70670 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NacaP70670 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NacaP70670 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NacaP70670 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NacaP70670 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NacaP70670 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NacaP70670 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NacaP70670 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NacaP70670 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NacaP70670 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NacaP70670 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NacaP70670 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NacaP70670 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NacaP70670 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NacaP70670 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NacaP70670 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NacaP70670 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NacaP70670 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NacaP70670 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NacaP70670 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NacaP70670 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NacaP70670 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NacaP70670 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NacaP70670 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NacaP70670 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NacaP70670 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NacaP70670 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NacaP70670 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NacaP70670 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NacaP70670 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NacaP70670 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NacaP70670 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NacaP70670 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NacaP70670 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NacaP70670 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NacaP70670 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NacaP70670 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NacaP70670 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NacaP70670 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NacaP70670 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NacaP70670 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NacaP70670 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NacaP70670 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NacaP70670 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NacaP70670 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NacaP70670 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NacaP70670 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NacaP70670 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NacaP70670 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NacaP70670 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NacaP70670 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NacaP70670 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NacaP70670 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms