Protein–RNA interactions for Protein: P63024

Vamp3, Vesicle-associated membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp3P63024 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp3P63024 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Vamp3P63024 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Vamp3P63024 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Vamp3P63024 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp3P63024 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Vamp3P63024 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp3P63024 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp3P63024 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Vamp3P63024 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Vamp3P63024 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vamp3P63024 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vamp3P63024 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp3P63024 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vamp3P63024 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vamp3P63024 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vamp3P63024 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Vamp3P63024 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Vamp3P63024 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Vamp3P63024 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Vamp3P63024 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Vamp3P63024 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Vamp3P63024 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Vamp3P63024 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Vamp3P63024 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Vamp3P63024 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Vamp3P63024 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Vamp3P63024 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Vamp3P63024 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Vamp3P63024 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Vamp3P63024 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vamp3P63024 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Vamp3P63024 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp3P63024 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Vamp3P63024 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vamp3P63024 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms