Protein–RNA interactions for Protein: P60330

Espl1, Separin, mousemouse

Predictions only

Length 2,118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Espl1P60330 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Espl1P60330 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Espl1P60330 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Espl1P60330 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Espl1P60330 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Espl1P60330 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Espl1P60330 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Espl1P60330 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Espl1P60330 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Espl1P60330 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Espl1P60330 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Espl1P60330 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Espl1P60330 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Espl1P60330 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Espl1P60330 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Espl1P60330 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Espl1P60330 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Espl1P60330 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Espl1P60330 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Espl1P60330 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Espl1P60330 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Espl1P60330 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Espl1P60330 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Espl1P60330 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Espl1P60330 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Espl1P60330 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Espl1P60330 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Espl1P60330 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Espl1P60330 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Espl1P60330 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Espl1P60330 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Espl1P60330 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Espl1P60330 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Espl1P60330 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Espl1P60330 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Espl1P60330 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Espl1P60330 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Espl1P60330 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Espl1P60330 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Espl1P60330 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Espl1P60330 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Espl1P60330 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Espl1P60330 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Espl1P60330 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Espl1P60330 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Espl1P60330 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Espl1P60330 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Espl1P60330 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Espl1P60330 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Espl1P60330 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Espl1P60330 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Espl1P60330 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Espl1P60330 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Espl1P60330 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Espl1P60330 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Espl1P60330 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Espl1P60330 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Espl1P60330 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Espl1P60330 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Espl1P60330 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Espl1P60330 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Espl1P60330 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Espl1P60330 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Espl1P60330 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Espl1P60330 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Espl1P60330 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Espl1P60330 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Espl1P60330 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Espl1P60330 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Espl1P60330 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Espl1P60330 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Espl1P60330 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Espl1P60330 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Espl1P60330 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms