Protein–RNA interactions for Protein: P55105

Bmp8b, Bone morphogenetic protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp8bP55105 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Bmp8bP55105 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Bmp8bP55105 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Bmp8bP55105 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Bmp8bP55105 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Bmp8bP55105 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Bmp8bP55105 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Bmp8bP55105 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Bmp8bP55105 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Bmp8bP55105 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Bmp8bP55105 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Bmp8bP55105 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bmp8bP55105 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Bmp8bP55105 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Bmp8bP55105 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bmp8bP55105 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Bmp8bP55105 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Bmp8bP55105 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Bmp8bP55105 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Bmp8bP55105 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bmp8bP55105 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Bmp8bP55105 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Bmp8bP55105 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bmp8bP55105 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Bmp8bP55105 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bmp8bP55105 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bmp8bP55105 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Bmp8bP55105 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bmp8bP55105 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Bmp8bP55105 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bmp8bP55105 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bmp8bP55105 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bmp8bP55105 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Bmp8bP55105 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp8bP55105 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp8bP55105 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Bmp8bP55105 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bmp8bP55105 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bmp8bP55105 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Bmp8bP55105 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Bmp8bP55105 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Bmp8bP55105 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bmp8bP55105 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Bmp8bP55105 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Bmp8bP55105 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bmp8bP55105 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bmp8bP55105 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bmp8bP55105 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Bmp8bP55105 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bmp8bP55105 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Bmp8bP55105 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bmp8bP55105 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bmp8bP55105 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bmp8bP55105 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bmp8bP55105 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bmp8bP55105 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bmp8bP55105 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Bmp8bP55105 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bmp8bP55105 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bmp8bP55105 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Bmp8bP55105 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Bmp8bP55105 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bmp8bP55105 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bmp8bP55105 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bmp8bP55105 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Bmp8bP55105 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bmp8bP55105 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bmp8bP55105 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bmp8bP55105 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Bmp8bP55105 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Bmp8bP55105 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bmp8bP55105 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bmp8bP55105 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Bmp8bP55105 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Bmp8bP55105 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Bmp8bP55105 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Bmp8bP55105 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp8bP55105 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp8bP55105 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Bmp8bP55105 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Bmp8bP55105 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Bmp8bP55105 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Bmp8bP55105 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms