Protein–RNA interactions for Protein: P55097

Ctsk, Cathepsin K, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtskP55097 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CtskP55097 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CtskP55097 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtskP55097 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CtskP55097 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CtskP55097 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CtskP55097 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CtskP55097 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CtskP55097 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CtskP55097 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CtskP55097 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CtskP55097 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CtskP55097 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CtskP55097 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CtskP55097 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CtskP55097 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CtskP55097 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CtskP55097 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CtskP55097 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CtskP55097 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CtskP55097 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CtskP55097 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CtskP55097 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CtskP55097 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CtskP55097 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CtskP55097 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtskP55097 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CtskP55097 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CtskP55097 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CtskP55097 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CtskP55097 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CtskP55097 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CtskP55097 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtskP55097 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtskP55097 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CtskP55097 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtskP55097 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CtskP55097 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CtskP55097 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtskP55097 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CtskP55097 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtskP55097 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtskP55097 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CtskP55097 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
CtskP55097 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CtskP55097 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CtskP55097 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CtskP55097 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CtskP55097 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtskP55097 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtskP55097 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CtskP55097 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CtskP55097 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CtskP55097 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CtskP55097 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CtskP55097 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CtskP55097 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CtskP55097 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CtskP55097 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CtskP55097 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CtskP55097 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CtskP55097 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CtskP55097 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CtskP55097 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtskP55097 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CtskP55097 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CtskP55097 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CtskP55097 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CtskP55097 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CtskP55097 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CtskP55097 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CtskP55097 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CtskP55097 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CtskP55097 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CtskP55097 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CtskP55097 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CtskP55097 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CtskP55097 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CtskP55097 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtskP55097 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CtskP55097 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CtskP55097 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtskP55097 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtskP55097 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CtskP55097 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CtskP55097 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CtskP55097 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CtskP55097 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CtskP55097 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CtskP55097 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CtskP55097 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CtskP55097 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CtskP55097 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CtskP55097 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CtskP55097 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CtskP55097 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CtskP55097 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CtskP55097 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtskP55097 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CtskP55097 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms