Protein–RNA interactions for Protein: P53749

YNR063W, Uncharacterized transcriptional regulatory protein YNR063W, yeastyeast

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YNR063WP53749 PUS2YGL063W 1113 nt12.58□□□□□ -0.4
YNR063WP53749 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.53□□□□□ -0.4
YNR063WP53749 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.51□□□□□ -0.41
YNR063WP53749 BDF1YLR399C 2061 nt12.49□□□□□ -0.41
YNR063WP53749 MEP2YNL142W 1500 nt12.48□□□□□ -0.41
YNR063WP53749 SIS1YNL007C 1059 nt12.47□□□□□ -0.41
YNR063WP53749 RPP2AYOL039W 321 nt12.38□□□□□ -0.43
YNR063WP53749 DSK2YMR276W 1122 nt12.37□□□□□ -0.43
YNR063WP53749 IMP2'YIL154C 1041 nt12.35□□□□□ -0.43
YNR063WP53749 YJL152WYJL152W 360 nt12.35□□□□□ -0.43
YNR063WP53749 PTP1YDL230W 1008 nt12.32□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 YPR011CYPR011C 981 nt12.32□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 YLR236CYLR236C 324 nt12.31□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 TAT1YBR069C 1860 nt12.31□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 TIR4YOR009W 1464 nt12.29□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 YCH1YGR203W 447 nt12.28□□□□□ -0.44
YNR063WP53749 ART5YGR068C 1761 nt12.25□□□□□ -0.45
YNR063WP53749 FMP45YDL222C 930 nt12.25□□□□□ -0.45
YNR063WP53749 PET9YBL030C 957 nt12.21□□□□□ -0.45
YNR063WP53749 IDH1YNL037C 1083 nt12.19□□□□□ -0.46
YNR063WP53749 GFD2YCL036W 1701 nt12.19□□□□□ -0.46
YNR063WP53749 CAC2YML102W 1407 nt12.19□□□□□ -0.46
YNR063WP53749 PAC11YDR488C 1602 nt12.16□□□□□ -0.46
YNR063WP53749 YMR057CYMR057C 372 nt12.14□□□□□ -0.47
YNR063WP53749 EMI2YDR516C 1503 nt12.11□□□□□ -0.47
YNR063WP53749 ERV46YAL042W 1248 nt12.1□□□□□ -0.47
YNR063WP53749 LPX1YOR084W 1164 nt12.09□□□□□ -0.47
YNR063WP53749 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.07□□□□□ -0.48
YNR063WP53749 GBP2YCL011C 1284 nt12.06□□□□□ -0.48
YNR063WP53749 YDR433WYDR433W 441 nt12.05□□□□□ -0.48
YNR063WP53749 YDL221WYDL221W 552 nt12.03□□□□□ -0.48
YNR063WP53749 YMR090WYMR090W 684 nt12.01□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 IRC15YPL017C 1500 nt12.01□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 RTS2YOR077W 699 nt12□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 YKR040CYKR040C 504 nt11.98□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 FPS1YLL043W 2010 nt11.98□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 YBR220CYBR220C 1683 nt11.97□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 NVJ2YPR091C 2313 nt11.97□□□□□ -0.49
YNR063WP53749 MXR2YCL033C 507 nt11.95□□□□□ -0.5
YNR063WP53749 GIS3YLR094C 1509 nt11.91□□□□□ -0.5
YNR063WP53749 TCD2YKL027W 1344 nt11.91□□□□□ -0.5
YNR063WP53749 CUE1YMR264W 612 nt11.91□□□□□ -0.5
YNR063WP53749 SPP1YPL138C 1062 nt11.91□□□□□ -0.5
YNR063WP53749 SDH1YKL148C 1923 nt11.9□□□□□ -0.5
YNR063WP53749 DED1YOR204W 1815 nt11.86□□□□□ -0.51
YNR063WP53749 RRD1YIL153W 1182 nt11.86□□□□□ -0.51
YNR063WP53749 MRPL8YJL063C 717 nt11.82□□□□□ -0.52
YNR063WP53749 SCC4YER147C 1875 nt11.82□□□□□ -0.52
YNR063WP53749 YIL100WYIL100W 354 nt11.76□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 FRD1YEL047C 1413 nt11.75□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 RTG1YOL067C 534 nt11.73□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 FMT1YBL013W 1206 nt11.72□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.71□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 YEL076CYEL076C 651 nt11.71□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 YLR464WYLR464W 651 nt11.71□□□□□ -0.53
YNR063WP53749 ADO1YJR105W 1023 nt11.69□□□□□ -0.54
YNR063WP53749 SOR2YDL246C 1074 nt11.68□□□□□ -0.54
YNR063WP53749 FMP52YER004W 696 nt11.68□□□□□ -0.54
YNR063WP53749 SOR1YJR159W 1074 nt11.68□□□□□ -0.54
YNR063WP53749 YCL042WYCL042W 360 nt11.68□□□□□ -0.54
YNR063WP53749 PCH2YBR186W 1695 nt11.64□□□□□ -0.55
YNR063WP53749 GUT2YIL155C 1950 nt11.63□□□□□ -0.55
YNR063WP53749 CWP1YKL096W 720 nt11.59□□□□□ -0.55
YNR063WP53749 ADH2YMR303C 1047 nt11.57□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 PTH1YHR189W 573 nt11.56□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 SEC11YIR022W 504 nt11.56□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 YNL195CYNL195C 786 nt11.55□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 YSC84YHR016C 1407 nt11.54□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 YLR235CYLR235C 399 nt11.54□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 PCM1YEL058W 1674 nt11.52□□□□□ -0.56
YNR063WP53749 HUA1YGR268C 597 nt11.52□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 YHL050CYHL050C 2094 nt11.51□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 NME1NME1 340 nt11.5□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 PIB2YGL023C 1908 nt11.5□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 RRT12YCR045C 1476 nt11.5□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 YKL030WYKL030W 606 nt11.49□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 SNF6YHL025W 999 nt11.47□□□□□ -0.57
YNR063WP53749 LCB1YMR296C 1677 nt11.43□□□□□ -0.58
YNR063WP53749 DIC1YLR348C 897 nt11.41□□□□□ -0.58
YNR063WP53749 RNQ1YCL028W 1218 nt11.38□□□□□ -0.59
YNR063WP53749 YIH1YCR059C 777 nt11.37□□□□□ -0.59
YNR063WP53749 UBX6YJL048C 1191 nt11.36□□□□□ -0.59
YNR063WP53749 TIM23YNR017W 669 nt11.36□□□□□ -0.59
YNR063WP53749 YLR179CYLR179C 606 nt11.29□□□□□ -0.6
YNR063WP53749 BIO4YNR057C 714 nt11.29□□□□□ -0.6
YNR063WP53749 SIM1YIL123W 1431 nt11.28□□□□□ -0.6
YNR063WP53749 RTF1YGL244W 1677 nt11.28□□□□□ -0.6
YNR063WP53749 YDR094WYDR094W 336 nt11.28□□□□□ -0.6
YNR063WP53749 YJL225CYJL225C 5277 nt11.27□□□□□ -0.6
YNR063WP53749 YLL053CYLL053C 459 nt11.25□□□□□ -0.61
YNR063WP53749 YGR139WYGR139W 339 nt11.24□□□□□ -0.61
YNR063WP53749 YPR064WYPR064W 420 nt11.22□□□□□ -0.61
YNR063WP53749 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.21□□□□□ -0.61
YNR063WP53749 NCP1YHR042W 2076 nt11.21□□□□□ -0.62
YNR063WP53749 WSC2YNL283C 1512 nt11.2□□□□□ -0.62
YNR063WP53749 FTR1YER145C 1215 nt11.19□□□□□ -0.62
YNR063WP53749 AHT1YHR093W 549 nt11.19□□□□□ -0.62
YNR063WP53749 BOP3YNL042W 1191 nt11.18□□□□□ -0.62
YNR063WP53749 GAL1YBR020W 1587 nt11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 39.7 ms