Protein–RNA interactions for Protein: P53271

COG2, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 2, yeastyeast

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
COG2P53271 NVJ2YPR091C 2313 nt12.1□□□□□ -0.47
COG2P53271 GFD2YCL036W 1701 nt12.09□□□□□ -0.47
COG2P53271 ART5YGR068C 1761 nt12.09□□□□□ -0.47
COG2P53271 SHU1YHL006C 453 nt12.08□□□□□ -0.48
COG2P53271 HOM6YJR139C 1080 nt12.07□□□□□ -0.48
COG2P53271 PCH2YBR186W 1695 nt12.06□□□□□ -0.48
COG2P53271 SEC11YIR022W 504 nt12.04□□□□□ -0.48
COG2P53271 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.04□□□□□ -0.48
COG2P53271 GUT2YIL155C 1950 nt12.01□□□□□ -0.49
COG2P53271 PET9YBL030C 957 nt12□□□□□ -0.49
COG2P53271 RTS2YOR077W 699 nt11.99□□□□□ -0.49
COG2P53271 FPS1YLL043W 2010 nt11.99□□□□□ -0.49
COG2P53271 MNP1YGL068W 585 nt11.94□□□□□ -0.5
COG2P53271 YSC84YHR016C 1407 nt11.94□□□□□ -0.5
COG2P53271 TIR4YOR009W 1464 nt11.91□□□□□ -0.5
COG2P53271 YCH1YGR203W 447 nt11.91□□□□□ -0.5
COG2P53271 CUE1YMR264W 612 nt11.9□□□□□ -0.5
COG2P53271 RKM5YLR137W 1104 nt11.89□□□□□ -0.51
COG2P53271 YHL050CYHL050C 2094 nt11.87□□□□□ -0.51
COG2P53271 PIB2YGL023C 1908 nt11.84□□□□□ -0.51
COG2P53271 RRT12YCR045C 1476 nt11.82□□□□□ -0.52
COG2P53271 YMR057CYMR057C 372 nt11.81□□□□□ -0.52
COG2P53271 NPL3YDR432W 1245 nt11.74□□□□□ -0.53
COG2P53271 RTF1YGL244W 1677 nt11.74□□□□□ -0.53
COG2P53271 YIL100WYIL100W 354 nt11.73□□□□□ -0.53
COG2P53271 YKL097CYKL097C 411 nt11.72□□□□□ -0.53
COG2P53271 YNL195CYNL195C 786 nt11.72□□□□□ -0.53
COG2P53271 YLR236CYLR236C 324 nt11.67□□□□□ -0.54
COG2P53271 BOP3YNL042W 1191 nt11.65□□□□□ -0.54
COG2P53271 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.63□□□□□ -0.55
COG2P53271 Q0182Q0182 405 nt11.62□□□□□ -0.55
COG2P53271 YJL152WYJL152W 360 nt11.62□□□□□ -0.55
COG2P53271 PTK1YKL198C 1989 nt11.58□□□□□ -0.56
COG2P53271 YOL037CYOL037C 354 nt11.55□□□□□ -0.56
COG2P53271 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.55□□□□□ -0.56
COG2P53271 NCP1YHR042W 2076 nt11.53□□□□□ -0.56
COG2P53271 LCB1YMR296C 1677 nt11.38□□□□□ -0.59
COG2P53271 WHI5YOR083W 888 nt11.37□□□□□ -0.59
COG2P53271 YOR139CYOR139C 393 nt11.37□□□□□ -0.59
COG2P53271 RRD1YIL153W 1182 nt11.34□□□□□ -0.59
COG2P53271 YLR281CYLR281C 468 nt11.34□□□□□ -0.59
COG2P53271 YFL054CYFL054C 1941 nt11.33□□□□□ -0.6
COG2P53271 YJL225CYJL225C 5277 nt11.29□□□□□ -0.6
COG2P53271 IDH1YNL037C 1083 nt11.27□□□□□ -0.61
COG2P53271 GBP2YCL011C 1284 nt11.27□□□□□ -0.61
COG2P53271 SPT8YLR055C 1809 nt11.26□□□□□ -0.61
COG2P53271 FMP52YER004W 696 nt11.26□□□□□ -0.61
COG2P53271 DED1YOR204W 1815 nt11.25□□□□□ -0.61
COG2P53271 PCM1YEL058W 1674 nt11.22□□□□□ -0.61
COG2P53271 TCD2YKL027W 1344 nt11.2□□□□□ -0.62
COG2P53271 SIM1YIL123W 1431 nt11.19□□□□□ -0.62
COG2P53271 FMT1YBL013W 1206 nt11.19□□□□□ -0.62
COG2P53271 MOT3YMR070W 1473 nt11.18□□□□□ -0.62
COG2P53271 UME6YDR207C 2511 nt11.16□□□□□ -0.62
COG2P53271 LYS4YDR234W 2082 nt11.15□□□□□ -0.62
COG2P53271 IMP2'YIL154C 1041 nt11.11□□□□□ -0.63
COG2P53271 ADH2YMR303C 1047 nt11.11□□□□□ -0.63
COG2P53271 CWP1YKL096W 720 nt11.1□□□□□ -0.63
COG2P53271 BIO4YNR057C 714 nt11.1□□□□□ -0.63
COG2P53271 SWE1YJL187C 2460 nt11.07□□□□□ -0.64
COG2P53271 SNF6YHL025W 999 nt11.07□□□□□ -0.64
COG2P53271 DSK2YMR276W 1122 nt11.07□□□□□ -0.64
COG2P53271 PUS2YGL063W 1113 nt11.06□□□□□ -0.64
COG2P53271 BOR1YNL275W 1731 nt11.04□□□□□ -0.64
COG2P53271 YDR433WYDR433W 441 nt11.03□□□□□ -0.64
COG2P53271 MXR2YCL033C 507 nt11.03□□□□□ -0.64
COG2P53271 SOR2YDL246C 1074 nt11.02□□□□□ -0.65
COG2P53271 SOR1YJR159W 1074 nt11.02□□□□□ -0.65
COG2P53271 YPR011CYPR011C 981 nt11.02□□□□□ -0.65
COG2P53271 FMP45YDL222C 930 nt11.01□□□□□ -0.65
COG2P53271 YIH1YCR059C 777 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 ERF2YLR246W 1080 nt10.96□□□□□ -0.65
COG2P53271 CRR1YLR213C 1269 nt10.95□□□□□ -0.66
COG2P53271 YCL042WYCL042W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
COG2P53271 ERV46YAL042W 1248 nt10.93□□□□□ -0.66
COG2P53271 YLL053CYLL053C 459 nt10.91□□□□□ -0.66
COG2P53271 FRD1YEL047C 1413 nt10.9□□□□□ -0.66
COG2P53271 YKR040CYKR040C 504 nt10.89□□□□□ -0.67
COG2P53271 LPX1YOR084W 1164 nt10.89□□□□□ -0.67
COG2P53271 RNQ1YCL028W 1218 nt10.89□□□□□ -0.67
COG2P53271 HSP60YLR259C 1719 nt10.89□□□□□ -0.67
COG2P53271 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.87□□□□□ -0.67
COG2P53271 ATF2YGR177C 1608 nt10.85□□□□□ -0.67
COG2P53271 MIC10YCL057C-A 294 nt10.84□□□□□ -0.67
COG2P53271 HEM12YDR047W 1089 nt10.83□□□□□ -0.68
COG2P53271 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.81□□□□□ -0.68
COG2P53271 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.81□□□□□ -0.68
COG2P53271 FTR1YER145C 1215 nt10.79□□□□□ -0.68
COG2P53271 SNG1YGR197C 1644 nt10.79□□□□□ -0.68
COG2P53271 YFL067WYFL067W 528 nt10.78□□□□□ -0.68
COG2P53271 GLK1YCL040W 1503 nt10.78□□□□□ -0.68
COG2P53271 RAX1YOR301W 1308 nt10.77□□□□□ -0.69
COG2P53271 CCA1YER168C 1641 nt10.76□□□□□ -0.69
COG2P53271 FUR4YBR021W 1902 nt10.76□□□□□ -0.69
COG2P53271 GAL1YBR020W 1587 nt10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100.1 ms