Protein–RNA interactions for Protein: P53189

SCW11, Probable family 17 glucosidase SCW11, yeast

Predictions only

Length 542 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCW11	P53189	VAR1	Q0140	1197 nt		11.35	□□□□□ -0.59
SCW11	P53189	PST2	YDR032C	597 nt		11.34	□□□□□ -0.59
SCW11	P53189	SIS1	YNL007C	1059 nt		11.32	□□□□□ -0.6
SCW11	P53189	PCH2	YBR186W	1695 nt		11.32	□□□□□ -0.6
SCW11	P53189	GIS3	YLR094C	1509 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SCW11	P53189	CCT6	YDR188W	1641 nt		11.31	□□□□□ -0.6
SCW11	P53189	GUT2	YIL155C	1950 nt		11.29	□□□□□ -0.6
SCW11	P53189	LSM3	YLR438C-A	270 nt		11.24	□□□□□ -0.61
SCW11	P53189	GFD2	YCL036W	1701 nt		11.23	□□□□□ -0.61
SCW11	P53189	ART5	YGR068C	1761 nt		11.23	□□□□□ -0.61
SCW11	P53189	REG2	YBR050C	1017 nt		11.23	□□□□□ -0.61
SCW11	P53189	SEC11	YIR022W	504 nt		11.22	□□□□□ -0.61
SCW11	P53189	RTS2	YOR077W	699 nt		11.2	□□□□□ -0.62
SCW11	P53189	YSC84	YHR016C	1407 nt		11.18	□□□□□ -0.62
SCW11	P53189	YDR509W	YDR509W	348 nt		11.18	□□□□□ -0.62
SCW11	P53189	SUF2	tP(AGG)C	72 nt		11.18	□□□□□ -0.62
SCW11	P53189	SUF10	tP(AGG)N	72 nt		11.18	□□□□□ -0.62
SCW11	P53189	PIB2	YGL023C	1908 nt		11.16	□□□□□ -0.62
SCW11	P53189	YHL050C	YHL050C	2094 nt		11.13	□□□□□ -0.63
SCW11	P53189	RRT12	YCR045C	1476 nt		11.09	□□□□□ -0.63
SCW11	P53189	YFL021C-A	YFL021C-A	855 nt		11.09	□□□□□ -0.63
SCW11	P53189	PET9	YBL030C	957 nt		11.07	□□□□□ -0.64
SCW11	P53189	BUR6	YER159C	429 nt		11.06	□□□□□ -0.64
SCW11	P53189	YAL037C-B	YAL037C-B	975 nt		11.03	□□□□□ -0.64
SCW11	P53189	CUE1	YMR264W	612 nt		11.03	□□□□□ -0.64
SCW11	P53189	TIR4	YOR009W	1464 nt		11.02	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	HOM6	YJR139C	1080 nt		11.02	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	BMT5	YIL096C	1011 nt		11.01	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	YGR021W	YGR021W	873 nt		11	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	RTF1	YGL244W	1677 nt		11	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	SHU1	YHL006C	453 nt		10.98	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	YKL097C	YKL097C	411 nt		10.97	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	NVJ2	YPR091C	2313 nt		10.96	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	YMR057C	YMR057C	372 nt		10.96	□□□□□ -0.65
SCW11	P53189	MNP1	YGL068W	585 nt		10.94	□□□□□ -0.66
SCW11	P53189	Q0144	Q0144	330 nt		10.93	□□□□□ -0.66
SCW11	P53189	YCH1	YGR203W	447 nt		10.92	□□□□□ -0.66
SCW11	P53189	FPS1	YLL043W	2010 nt		10.9	□□□□□ -0.66
SCW11	P53189	PTK1	YKL198C	1989 nt		10.9	□□□□□ -0.66
SCW11	P53189	BOP3	YNL042W	1191 nt		10.88	□□□□□ -0.67
SCW11	P53189	YNL195C	YNL195C	786 nt		10.87	□□□□□ -0.67
SCW11	P53189	YIL100W	YIL100W	354 nt		10.86	□□□□□ -0.67
SCW11	P53189	Q0010	Q0010	387 nt		10.86	□□□□□ -0.67
SCW11	P53189	RKM5	YLR137W	1104 nt		10.85	□□□□□ -0.67
SCW11	P53189	NCP1	YHR042W	2076 nt		10.79	□□□□□ -0.68
SCW11	P53189	SEM1	YDR363W-A	270 nt		10.78	□□□□□ -0.68
SCW11	P53189	NPL3	YDR432W	1245 nt		10.78	□□□□□ -0.68
SCW11	P53189	YLR236C	YLR236C	324 nt		10.76	□□□□□ -0.69
SCW11	P53189	YIR018C-A	YIR018C-A	138 nt		10.73	□□□□□ -0.69
SCW11	P53189	SRN2	YLR119W	642 nt		10.73	□□□□□ -0.69
SCW11	P53189	YJL152W	YJL152W	360 nt		10.7	□□□□□ -0.7
SCW11	P53189	ARA2	YMR041C	1008 nt		10.66	□□□□□ -0.7
SCW11	P53189	YLR154C-G	YLR154C-G	150 nt		10.65	□□□□□ -0.7
SCW11	P53189	YFL054C	YFL054C	1941 nt		10.64	□□□□□ -0.71
SCW11	P53189	YCL048W-A	YCL048W-A	240 nt		10.63	□□□□□ -0.71
SCW11	P53189	LCB1	YMR296C	1677 nt		10.63	□□□□□ -0.71
SCW11	P53189	SPT8	YLR055C	1809 nt		10.57	□□□□□ -0.72
SCW11	P53189	ARP10	YDR106W	855 nt		10.51	□□□□□ -0.73
SCW11	P53189	YEL009C-A	YEL009C-A	408 nt		10.51	□□□□□ -0.73
SCW11	P53189	YOR139C	YOR139C	393 nt		10.51	□□□□□ -0.73
SCW11	P53189	ABZ2	YMR289W	1125 nt		10.49	□□□□□ -0.73
SCW11	P53189	YLR122C	YLR122C	378 nt		10.48	□□□□□ -0.73
SCW11	P53189	RRD1	YIL153W	1182 nt		10.47	□□□□□ -0.73
SCW11	P53189	BOR1	YNL275W	1731 nt		10.44	□□□□□ -0.74
SCW11	P53189	Q0142	Q0142	177 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SCW11	P53189	YOL037C	YOL037C	354 nt		10.42	□□□□□ -0.74
SCW11	P53189	LYS4	YDR234W	2082 nt		10.4	□□□□□ -0.74
SCW11	P53189	DED1	YOR204W	1815 nt		10.39	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	SWE1	YJL187C	2460 nt		10.39	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	SIM1	YIL123W	1431 nt		10.38	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	PCM1	YEL058W	1674 nt		10.38	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	AI5_BETA	Q0075	1065 nt		10.37	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	FMT1	YBL013W	1206 nt		10.36	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	WHI5	YOR083W	888 nt		10.36	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	MET8	YBR213W	825 nt		10.36	□□□□□ -0.75
SCW11	P53189	YCR099C	YCR099C	468 nt		10.33	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	PET20	YPL159C	762 nt		10.33	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	GBP2	YCL011C	1284 nt		10.33	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	FMP52	YER004W	696 nt		10.31	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	AI3	Q0060	1248 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	YLR281C	YLR281C	468 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	ADH2	YMR303C	1047 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	BIO4	YNR057C	714 nt		10.29	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	IDH1	YNL037C	1083 nt		10.28	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	HSP60	YLR259C	1719 nt		10.27	□□□□□ -0.76
SCW11	P53189	UME6	YDR207C	2511 nt		10.27	□□□□□ -0.77
SCW11	P53189	TCD2	YKL027W	1344 nt		10.26	□□□□□ -0.77
SCW11	P53189	CWP1	YKL096W	720 nt		10.25	□□□□□ -0.77
SCW11	P53189	Q0017	Q0017	162 nt		10.25	□□□□□ -0.77
SCW11	P53189	CLB6	YGR109C	1143 nt		10.21	□□□□□ -0.77
SCW11	P53189	SNF6	YHL025W	999 nt		10.21	□□□□□ -0.77
SCW11	P53189	UTP6	YDR449C	1323 nt		10.21	□□□□□ -0.78
SCW11	P53189	snR78	snR78	87 nt		10.17	□□□□□ -0.78
SCW11	P53189	MXR2	YCL033C	507 nt		10.16	□□□□□ -0.78
SCW11	P53189	TOM20	YGR082W	552 nt		10.15	□□□□□ -0.78
SCW11	P53189	GLK1	YCL040W	1503 nt		10.13	□□□□□ -0.79
SCW11	P53189	YNR068C	YNR068C	819 nt		10.13	□□□□□ -0.79
SCW11	P53189	CRR1	YLR213C	1269 nt		10.12	□□□□□ -0.79
SCW11	P53189	ERF2	YLR246W	1080 nt		10.11	□□□□□ -0.79
SCW11	P53189	MIC10	YCL057C-A	294 nt		10.11	□□□□□ -0.79

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