Protein–RNA interactions for Protein: P53104

ATG1, Serine/threonine-protein kinase ATG1, yeastyeast

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Length 897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG1P53104 FUN26YAL022C 1554 nt13.88□□□□□ -0.19
ATG1P53104 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.86□□□□□ -0.19
ATG1P53104 YEL076CYEL076C 651 nt13.86□□□□□ -0.19
ATG1P53104 YLR464WYLR464W 651 nt13.86□□□□□ -0.19
ATG1P53104 FIS1YIL065C 468 nt13.85□□□□□ -0.19
ATG1P53104 UBX6YJL048C 1191 nt13.84□□□□□ -0.19
ATG1P53104 CCT6YDR188W 1641 nt13.82□□□□□ -0.2
ATG1P53104 PHO4YFR034C 939 nt13.79□□□□□ -0.2
ATG1P53104 ERV46YAL042W 1248 nt13.75□□□□□ -0.21
ATG1P53104 LPX1YOR084W 1164 nt13.73□□□□□ -0.21
ATG1P53104 SIS1YNL007C 1059 nt13.71□□□□□ -0.21
ATG1P53104 RTG1YOL067C 534 nt13.71□□□□□ -0.21
ATG1P53104 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.7□□□□□ -0.22
ATG1P53104 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.7□□□□□ -0.22
ATG1P53104 SPP1YPL138C 1062 nt13.67□□□□□ -0.22
ATG1P53104 IDH1YNL037C 1083 nt13.65□□□□□ -0.22
ATG1P53104 YJL152WYJL152W 360 nt13.63□□□□□ -0.23
ATG1P53104 ALF1YNL148C 765 nt13.58□□□□□ -0.24
ATG1P53104 YDR433WYDR433W 441 nt13.56□□□□□ -0.24
ATG1P53104 YKR040CYKR040C 504 nt13.56□□□□□ -0.24
ATG1P53104 SSA4YER103W 1929 nt13.54□□□□□ -0.24
ATG1P53104 YDR094WYDR094W 336 nt13.52□□□□□ -0.25
ATG1P53104 HUA1YGR268C 597 nt13.52□□□□□ -0.25
ATG1P53104 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.42□□□□□ -0.26
ATG1P53104 MEP2YNL142W 1500 nt13.42□□□□□ -0.26
ATG1P53104 GBP2YCL011C 1284 nt13.41□□□□□ -0.26
ATG1P53104 YPS1YLR120C 1710 nt13.38□□□□□ -0.27
ATG1P53104 YDR095CYDR095C 411 nt13.34□□□□□ -0.27
ATG1P53104 MXR2YCL033C 507 nt13.33□□□□□ -0.28
ATG1P53104 TIR4YOR009W 1464 nt13.29□□□□□ -0.28
ATG1P53104 DCW1YKL046C 1350 nt13.26□□□□□ -0.29
ATG1P53104 CAC2YML102W 1407 nt13.21□□□□□ -0.3
ATG1P53104 TCD2YKL027W 1344 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG1P53104 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.19□□□□□ -0.3
ATG1P53104 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.17□□□□□ -0.3
ATG1P53104 BDF1YLR399C 2061 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG1P53104 RPP2AYOL039W 321 nt13.1□□□□□ -0.31
ATG1P53104 FRD1YEL047C 1413 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG1P53104 YKL030WYKL030W 606 nt13.08□□□□□ -0.32
ATG1P53104 PET9YBL030C 957 nt13.07□□□□□ -0.32
ATG1P53104 YMR057CYMR057C 372 nt13.06□□□□□ -0.32
ATG1P53104 YLR235CYLR235C 399 nt13.05□□□□□ -0.32
ATG1P53104 ART5YGR068C 1761 nt13.04□□□□□ -0.32
ATG1P53104 PTP1YDL230W 1008 nt13.04□□□□□ -0.32
ATG1P53104 SBA1YKL117W 651 nt13.03□□□□□ -0.32
ATG1P53104 EMI2YDR516C 1503 nt13.03□□□□□ -0.32
ATG1P53104 PTH1YHR189W 573 nt13□□□□□ -0.33
ATG1P53104 DED1YOR204W 1815 nt12.99□□□□□ -0.33
ATG1P53104 YCL042WYCL042W 360 nt12.96□□□□□ -0.33
ATG1P53104 PAU16YKL224C 372 nt12.94□□□□□ -0.34
ATG1P53104 NME1NME1 340 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG1P53104 GFD2YCL036W 1701 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG1P53104 YBR220CYBR220C 1683 nt12.93□□□□□ -0.34
ATG1P53104 RRD1YIL153W 1182 nt12.92□□□□□ -0.34
ATG1P53104 LCB1YMR296C 1677 nt12.91□□□□□ -0.34
ATG1P53104 TAT1YBR069C 1860 nt12.91□□□□□ -0.34
ATG1P53104 YDL221WYDL221W 552 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG1P53104 SOR2YDL246C 1074 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG1P53104 YFR018CYFR018C 1092 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG1P53104 SOR1YJR159W 1074 nt12.9□□□□□ -0.34
ATG1P53104 RRT5YFR032C 870 nt12.89□□□□□ -0.35
ATG1P53104 YMR090WYMR090W 684 nt12.84□□□□□ -0.35
ATG1P53104 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG1P53104 SDH1YKL148C 1923 nt12.82□□□□□ -0.36
ATG1P53104 FPS1YLL043W 2010 nt12.81□□□□□ -0.36
ATG1P53104 IRC15YPL017C 1500 nt12.8□□□□□ -0.36
ATG1P53104 FMT1YBL013W 1206 nt12.79□□□□□ -0.36
ATG1P53104 FMP52YER004W 696 nt12.71□□□□□ -0.37
ATG1P53104 PRE6YOL038W 765 nt12.71□□□□□ -0.37
ATG1P53104 TIM23YNR017W 669 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG1P53104 GIS3YLR094C 1509 nt12.69□□□□□ -0.38
ATG1P53104 SCC4YER147C 1875 nt12.68□□□□□ -0.38
ATG1P53104 SNF6YHL025W 999 nt12.66□□□□□ -0.38
ATG1P53104 DIC1YLR348C 897 nt12.65□□□□□ -0.38
ATG1P53104 RTS2YOR077W 699 nt12.65□□□□□ -0.38
ATG1P53104 CWP1YKL096W 720 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG1P53104 YPR064WYPR064W 420 nt12.62□□□□□ -0.39
ATG1P53104 CUE1YMR264W 612 nt12.59□□□□□ -0.39
ATG1P53104 YLR179CYLR179C 606 nt12.58□□□□□ -0.4
ATG1P53104 TAD3YLR316C 969 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG1P53104 NAT4YMR069W 858 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG1P53104 ADH2YMR303C 1047 nt12.55□□□□□ -0.4
ATG1P53104 PCH2YBR186W 1695 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG1P53104 AHT1YHR093W 549 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG1P53104 YIL100WYIL100W 354 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG1P53104 PEX25YPL112C 1185 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG1P53104 WSC2YNL283C 1512 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG1P53104 YSC84YHR016C 1407 nt12.44□□□□□ -0.42
ATG1P53104 YFL066CYFL066C 1179 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG1P53104 GUT2YIL155C 1950 nt12.43□□□□□ -0.42
ATG1P53104 GLK1YCL040W 1503 nt12.42□□□□□ -0.42
ATG1P53104 RNQ1YCL028W 1218 nt12.42□□□□□ -0.42
ATG1P53104 SEC11YIR022W 504 nt12.41□□□□□ -0.42
ATG1P53104 YHL050CYHL050C 2094 nt12.41□□□□□ -0.42
ATG1P53104 PCM1YEL058W 1674 nt12.4□□□□□ -0.42
ATG1P53104 RRT12YCR045C 1476 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG1P53104 YIH1YCR059C 777 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG1P53104 YGR139WYGR139W 339 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG1P53104 MSF1YPR047W 1410 nt12.36□□□□□ -0.43
ATG1P53104 PIB2YGL023C 1908 nt12.33□□□□□ -0.44
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