Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pold1P52431 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pold1P52431 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pold1P52431 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pold1P52431 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pold1P52431 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pold1P52431 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pold1P52431 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pold1P52431 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pold1P52431 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pold1P52431 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pold1P52431 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pold1P52431 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pold1P52431 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Pold1P52431 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pold1P52431 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pold1P52431 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pold1P52431 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pold1P52431 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pold1P52431 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pold1P52431 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pold1P52431 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pold1P52431 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pold1P52431 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pold1P52431 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pold1P52431 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pold1P52431 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pold1P52431 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pold1P52431 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pold1P52431 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pold1P52431 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pold1P52431 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Pold1P52431 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pold1P52431 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pold1P52431 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pold1P52431 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pold1P52431 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Pold1P52431 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Pold1P52431 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pold1P52431 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pold1P52431 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Pold1P52431 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pold1P52431 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Pold1P52431 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pold1P52431 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Pold1P52431 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pold1P52431 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pold1P52431 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pold1P52431 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pold1P52431 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Pold1P52431 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pold1P52431 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pold1P52431 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pold1P52431 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pold1P52431 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pold1P52431 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pold1P52431 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pold1P52431 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pold1P52431 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pold1P52431 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Pold1P52431 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pold1P52431 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pold1P52431 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pold1P52431 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pold1P52431 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pold1P52431 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pold1P52431 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pold1P52431 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pold1P52431 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pold1P52431 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pold1P52431 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pold1P52431 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pold1P52431 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pold1P52431 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pold1P52431 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pold1P52431 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pold1P52431 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pold1P52431 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pold1P52431 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pold1P52431 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pold1P52431 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pold1P52431 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms