Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Tmod1P49813 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmod1P49813 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tmod1P49813 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Tmod1P49813 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tmod1P49813 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tmod1P49813 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Tmod1P49813 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Tmod1P49813 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Tmod1P49813 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Tmod1P49813 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Tmod1P49813 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Tmod1P49813 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Tmod1P49813 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Tmod1P49813 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Tmod1P49813 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Tmod1P49813 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmod1P49813 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Tmod1P49813 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Tmod1P49813 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tmod1P49813 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tmod1P49813 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmod1P49813 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Tmod1P49813 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Tmod1P49813 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Tmod1P49813 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmod1P49813 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tmod1P49813 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Tmod1P49813 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmod1P49813 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tmod1P49813 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tmod1P49813 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tmod1P49813 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tmod1P49813 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmod1P49813 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tmod1P49813 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tmod1P49813 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tmod1P49813 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tmod1P49813 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmod1P49813 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmod1P49813 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmod1P49813 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tmod1P49813 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tmod1P49813 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmod1P49813 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmod1P49813 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmod1P49813 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmod1P49813 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmod1P49813 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmod1P49813 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmod1P49813 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmod1P49813 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmod1P49813 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmod1P49813 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmod1P49813 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmod1P49813 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tmod1P49813 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tmod1P49813 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tmod1P49813 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tmod1P49813 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tmod1P49813 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmod1P49813 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tmod1P49813 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmod1P49813 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmod1P49813 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tmod1P49813 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tmod1P49813 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tmod1P49813 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmod1P49813 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tmod1P49813 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmod1P49813 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tmod1P49813 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tmod1P49813 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tmod1P49813 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tmod1P49813 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tmod1P49813 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod1P49813 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tmod1P49813 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tmod1P49813 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmod1P49813 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tmod1P49813 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tmod1P49813 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tmod1P49813 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tmod1P49813 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tmod1P49813 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Tmod1P49813 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms