Protein–RNA interactions for Protein: P46969

RPE1, Ribulose-phosphate 3-epimerase, yeastyeast

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPE1P46969 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.31□□□□□ -0.6
RPE1P46969 ALF1YNL148C 765 nt11.3□□□□□ -0.6
RPE1P46969 YBR220CYBR220C 1683 nt11.3□□□□□ -0.6
RPE1P46969 CCT6YDR188W 1641 nt11.28□□□□□ -0.6
RPE1P46969 YLR281CYLR281C 468 nt11.26□□□□□ -0.61
RPE1P46969 YDL221WYDL221W 552 nt11.25□□□□□ -0.61
RPE1P46969 RPP2AYOL039W 321 nt11.23□□□□□ -0.61
RPE1P46969 WHI5YOR083W 888 nt11.21□□□□□ -0.61
RPE1P46969 CAC2YML102W 1407 nt11.2□□□□□ -0.62
RPE1P46969 FPS1YLL043W 2010 nt11.2□□□□□ -0.62
RPE1P46969 SDH1YKL148C 1923 nt11.2□□□□□ -0.62
RPE1P46969 PUS2YGL063W 1113 nt11.2□□□□□ -0.62
RPE1P46969 PTP1YDL230W 1008 nt11.19□□□□□ -0.62
RPE1P46969 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPE1P46969 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPE1P46969 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.11□□□□□ -0.63
RPE1P46969 SCC4YER147C 1875 nt11.08□□□□□ -0.64
RPE1P46969 SIS1YNL007C 1059 nt11.05□□□□□ -0.64
RPE1P46969 IRC15YPL017C 1500 nt11.03□□□□□ -0.64
RPE1P46969 PCH2YBR186W 1695 nt10.99□□□□□ -0.65
RPE1P46969 SEC11YIR022W 504 nt10.99□□□□□ -0.65
RPE1P46969 DSK2YMR276W 1122 nt10.99□□□□□ -0.65
RPE1P46969 GIS3YLR094C 1509 nt10.99□□□□□ -0.65
RPE1P46969 YJL152WYJL152W 360 nt10.97□□□□□ -0.65
RPE1P46969 YPR011CYPR011C 981 nt10.97□□□□□ -0.65
RPE1P46969 IMP2'YIL154C 1041 nt10.96□□□□□ -0.65
RPE1P46969 YLR236CYLR236C 324 nt10.96□□□□□ -0.65
RPE1P46969 ART5YGR068C 1761 nt10.95□□□□□ -0.66
RPE1P46969 GFD2YCL036W 1701 nt10.94□□□□□ -0.66
RPE1P46969 GUT2YIL155C 1950 nt10.94□□□□□ -0.66
RPE1P46969 RTS2YOR077W 699 nt10.92□□□□□ -0.66
RPE1P46969 MOT3YMR070W 1473 nt10.92□□□□□ -0.66
RPE1P46969 FMP45YDL222C 930 nt10.91□□□□□ -0.66
RPE1P46969 TIR4YOR009W 1464 nt10.91□□□□□ -0.66
RPE1P46969 YCH1YGR203W 447 nt10.9□□□□□ -0.66
RPE1P46969 YSC84YHR016C 1407 nt10.87□□□□□ -0.67
RPE1P46969 PET9YBL030C 957 nt10.85□□□□□ -0.67
RPE1P46969 IDH1YNL037C 1083 nt10.83□□□□□ -0.68
RPE1P46969 YMR057CYMR057C 372 nt10.78□□□□□ -0.68
RPE1P46969 CUE1YMR264W 612 nt10.78□□□□□ -0.68
RPE1P46969 YHL050CYHL050C 2094 nt10.77□□□□□ -0.69
RPE1P46969 LPX1YOR084W 1164 nt10.76□□□□□ -0.69
RPE1P46969 ERV46YAL042W 1248 nt10.75□□□□□ -0.69
RPE1P46969 YNL195CYNL195C 786 nt10.74□□□□□ -0.69
RPE1P46969 GBP2YCL011C 1284 nt10.72□□□□□ -0.69
RPE1P46969 RRT12YCR045C 1476 nt10.72□□□□□ -0.69
RPE1P46969 YDR433WYDR433W 441 nt10.71□□□□□ -0.69
RPE1P46969 PIB2YGL023C 1908 nt10.71□□□□□ -0.69
RPE1P46969 RTF1YGL244W 1677 nt10.71□□□□□ -0.69
RPE1P46969 YIL100WYIL100W 354 nt10.71□□□□□ -0.69
RPE1P46969 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.7□□□□□ -0.7
RPE1P46969 YKR040CYKR040C 504 nt10.64□□□□□ -0.71
RPE1P46969 BOP3YNL042W 1191 nt10.63□□□□□ -0.71
RPE1P46969 MXR2YCL033C 507 nt10.63□□□□□ -0.71
RPE1P46969 UME6YDR207C 2511 nt10.62□□□□□ -0.71
RPE1P46969 SPP1YPL138C 1062 nt10.61□□□□□ -0.71
RPE1P46969 TCD2YKL027W 1344 nt10.58□□□□□ -0.72
RPE1P46969 DED1YOR204W 1815 nt10.52□□□□□ -0.73
RPE1P46969 RRD1YIL153W 1182 nt10.52□□□□□ -0.73
RPE1P46969 MRPL8YJL063C 717 nt10.52□□□□□ -0.73
RPE1P46969 PTK1YKL198C 1989 nt10.5□□□□□ -0.73
RPE1P46969 RTG1YOL067C 534 nt10.45□□□□□ -0.74
RPE1P46969 FRD1YEL047C 1413 nt10.43□□□□□ -0.74
RPE1P46969 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.43□□□□□ -0.74
RPE1P46969 YEL076CYEL076C 651 nt10.43□□□□□ -0.74
RPE1P46969 YLR464WYLR464W 651 nt10.43□□□□□ -0.74
RPE1P46969 FMT1YBL013W 1206 nt10.41□□□□□ -0.74
RPE1P46969 NCP1YHR042W 2076 nt10.4□□□□□ -0.74
RPE1P46969 ADO1YJR105W 1023 nt10.4□□□□□ -0.74
RPE1P46969 YCL042WYCL042W 360 nt10.37□□□□□ -0.75
RPE1P46969 SOR2YDL246C 1074 nt10.36□□□□□ -0.75
RPE1P46969 SOR1YJR159W 1074 nt10.36□□□□□ -0.75
RPE1P46969 YFL054CYFL054C 1941 nt10.36□□□□□ -0.75
RPE1P46969 FMP52YER004W 696 nt10.34□□□□□ -0.75
RPE1P46969 YJL225CYJL225C 5277 nt10.33□□□□□ -0.76
RPE1P46969 BOR1YNL275W 1731 nt10.33□□□□□ -0.76
RPE1P46969 LCB1YMR296C 1677 nt10.3□□□□□ -0.76
RPE1P46969 PTH1YHR189W 573 nt10.29□□□□□ -0.76
RPE1P46969 CWP1YKL096W 720 nt10.29□□□□□ -0.76
RPE1P46969 ADH2YMR303C 1047 nt10.27□□□□□ -0.77
RPE1P46969 SPT8YLR055C 1809 nt10.26□□□□□ -0.77
RPE1P46969 HUA1YGR268C 597 nt10.25□□□□□ -0.77
RPE1P46969 YLR235CYLR235C 399 nt10.25□□□□□ -0.77
RPE1P46969 PCM1YEL058W 1674 nt10.22□□□□□ -0.77
RPE1P46969 YKL030WYKL030W 606 nt10.21□□□□□ -0.77
RPE1P46969 MCH5YOR306C 1566 nt10.18□□□□□ -0.78
RPE1P46969 SIM1YIL123W 1431 nt10.17□□□□□ -0.78
RPE1P46969 SNF6YHL025W 999 nt10.17□□□□□ -0.78
RPE1P46969 UBX6YJL048C 1191 nt10.15□□□□□ -0.78
RPE1P46969 DIC1YLR348C 897 nt10.13□□□□□ -0.79
RPE1P46969 TIM23YNR017W 669 nt10.09□□□□□ -0.79
RPE1P46969 RNQ1YCL028W 1218 nt10.09□□□□□ -0.79
RPE1P46969 YIH1YCR059C 777 nt10.08□□□□□ -0.8
RPE1P46969 SWE1YJL187C 2460 nt10.07□□□□□ -0.8
RPE1P46969 LYS4YDR234W 2082 nt10.06□□□□□ -0.8
RPE1P46969 YDR094WYDR094W 336 nt10.05□□□□□ -0.8
RPE1P46969 YLR179CYLR179C 606 nt10.03□□□□□ -0.8
RPE1P46969 BIO4YNR057C 714 nt10.03□□□□□ -0.8
RPE1P46969 YLL053CYLL053C 459 nt9.98□□□□□ -0.81
RPE1P46969 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms