Protein–RNA interactions for Protein: P43688

Nkx2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-6P43688 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Nkx2-6P43688 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Nkx2-6P43688 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-6P43688 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Nkx2-6P43688 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Nkx2-6P43688 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Nkx2-6P43688 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx2-6P43688 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-6P43688 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx2-6P43688 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx2-6P43688 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx2-6P43688 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx2-6P43688 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx2-6P43688 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-6P43688 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nkx2-6P43688 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nkx2-6P43688 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nkx2-6P43688 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nkx2-6P43688 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-6P43688 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nkx2-6P43688 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nkx2-6P43688 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nkx2-6P43688 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nkx2-6P43688 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-6P43688 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nkx2-6P43688 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nkx2-6P43688 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nkx2-6P43688 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-6P43688 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nkx2-6P43688 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nkx2-6P43688 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx2-6P43688 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nkx2-6P43688 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nkx2-6P43688 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nkx2-6P43688 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Nkx2-6P43688 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Nkx2-6P43688 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx2-6P43688 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Nkx2-6P43688 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Nkx2-6P43688 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Nkx2-6P43688 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-6P43688 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Nkx2-6P43688 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Nkx2-6P43688 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-6P43688 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-6P43688 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Nkx2-6P43688 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Nkx2-6P43688 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Nkx2-6P43688 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Nkx2-6P43688 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Nkx2-6P43688 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Nkx2-6P43688 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Nkx2-6P43688 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Nkx2-6P43688 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nkx2-6P43688 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Nkx2-6P43688 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nkx2-6P43688 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Nkx2-6P43688 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nkx2-6P43688 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nkx2-6P43688 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Nkx2-6P43688 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Nkx2-6P43688 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nkx2-6P43688 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nkx2-6P43688 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nkx2-6P43688 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nkx2-6P43688 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-6P43688 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nkx2-6P43688 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nkx2-6P43688 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nkx2-6P43688 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-6P43688 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nkx2-6P43688 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nkx2-6P43688 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nkx2-6P43688 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Nkx2-6P43688 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nkx2-6P43688 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms