Protein–RNA interactions for Protein: P40501

AVT7, Vacuolar amino acid transporter 7, yeastyeast

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVT7P40501 CCT6YDR188W 1641 nt10.92□□□□□ -0.66
AVT7P40501 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt10.89□□□□□ -0.67
AVT7P40501 IMT4tM(CAU)E 72 nt10.89□□□□□ -0.67
AVT7P40501 IMT3tM(CAU)J3 72 nt10.89□□□□□ -0.67
AVT7P40501 IMT1tM(CAU)O1 72 nt10.89□□□□□ -0.67
AVT7P40501 IMT2tM(CAU)P 72 nt10.89□□□□□ -0.67
AVT7P40501 SUF2tP(AGG)C 72 nt10.88□□□□□ -0.67
AVT7P40501 SUF10tP(AGG)N 72 nt10.88□□□□□ -0.67
AVT7P40501 SDH1YKL148C 1923 nt10.88□□□□□ -0.67
AVT7P40501 SIS1YNL007C 1059 nt10.87□□□□□ -0.67
AVT7P40501 PAC11YDR488C 1602 nt10.84□□□□□ -0.67
AVT7P40501 YLR281CYLR281C 468 nt10.83□□□□□ -0.68
AVT7P40501 PUS2YGL063W 1113 nt10.79□□□□□ -0.68
AVT7P40501 WHI5YOR083W 888 nt10.78□□□□□ -0.68
AVT7P40501 IRC15YPL017C 1500 nt10.77□□□□□ -0.69
AVT7P40501 SCC4YER147C 1875 nt10.76□□□□□ -0.69
AVT7P40501 GFD2YCL036W 1701 nt10.7□□□□□ -0.7
AVT7P40501 ART5YGR068C 1761 nt10.7□□□□□ -0.7
AVT7P40501 GIS3YLR094C 1509 nt10.68□□□□□ -0.7
AVT7P40501 SEC11YIR022W 504 nt10.67□□□□□ -0.7
AVT7P40501 PET9YBL030C 957 nt10.66□□□□□ -0.7
AVT7P40501 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.65□□□□□ -0.7
AVT7P40501 PCH2YBR186W 1695 nt10.63□□□□□ -0.71
AVT7P40501 YCH1YGR203W 447 nt10.61□□□□□ -0.71
AVT7P40501 IMP2'YIL154C 1041 nt10.61□□□□□ -0.71
AVT7P40501 RTS2YOR077W 699 nt10.61□□□□□ -0.71
AVT7P40501 DSK2YMR276W 1122 nt10.59□□□□□ -0.71
AVT7P40501 GUT2YIL155C 1950 nt10.57□□□□□ -0.72
AVT7P40501 MOT3YMR070W 1473 nt10.56□□□□□ -0.72
AVT7P40501 CUE1YMR264W 612 nt10.55□□□□□ -0.72
AVT7P40501 TIR4YOR009W 1464 nt10.55□□□□□ -0.72
AVT7P40501 NVJ2YPR091C 2313 nt10.54□□□□□ -0.72
AVT7P40501 YSC84YHR016C 1407 nt10.53□□□□□ -0.72
AVT7P40501 FMP45YDL222C 930 nt10.53□□□□□ -0.72
AVT7P40501 YJL152WYJL152W 360 nt10.53□□□□□ -0.72
AVT7P40501 YLR236CYLR236C 324 nt10.49□□□□□ -0.73
AVT7P40501 YMR057CYMR057C 372 nt10.48□□□□□ -0.73
AVT7P40501 YPR011CYPR011C 981 nt10.47□□□□□ -0.73
AVT7P40501 YHL050CYHL050C 2094 nt10.45□□□□□ -0.74
AVT7P40501 YNL195CYNL195C 786 nt10.44□□□□□ -0.74
AVT7P40501 YIL100WYIL100W 354 nt10.43□□□□□ -0.74
AVT7P40501 IDH1YNL037C 1083 nt10.43□□□□□ -0.74
AVT7P40501 RRT12YCR045C 1476 nt10.42□□□□□ -0.74
AVT7P40501 FPS1YLL043W 2010 nt10.38□□□□□ -0.75
AVT7P40501 PIB2YGL023C 1908 nt10.37□□□□□ -0.75
AVT7P40501 RTF1YGL244W 1677 nt10.35□□□□□ -0.75
AVT7P40501 ERV46YAL042W 1248 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT7P40501 LPX1YOR084W 1164 nt10.32□□□□□ -0.76
AVT7P40501 BOP3YNL042W 1191 nt10.31□□□□□ -0.76
AVT7P40501 YDR433WYDR433W 441 nt10.3□□□□□ -0.76
AVT7P40501 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.3□□□□□ -0.76
AVT7P40501 GBP2YCL011C 1284 nt10.28□□□□□ -0.76
AVT7P40501 YJL225CYJL225C 5277 nt10.26□□□□□ -0.77
AVT7P40501 MRPL8YJL063C 717 nt10.24□□□□□ -0.77
AVT7P40501 YKR040CYKR040C 504 nt10.23□□□□□ -0.77
AVT7P40501 PTK1YKL198C 1989 nt10.17□□□□□ -0.78
AVT7P40501 TCD2YKL027W 1344 nt10.15□□□□□ -0.78
AVT7P40501 SPP1YPL138C 1062 nt10.15□□□□□ -0.78
AVT7P40501 MXR2YCL033C 507 nt10.15□□□□□ -0.78
AVT7P40501 ADO1YJR105W 1023 nt10.14□□□□□ -0.79
AVT7P40501 NCP1YHR042W 2076 nt10.13□□□□□ -0.79
AVT7P40501 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT7P40501 YEL076CYEL076C 651 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT7P40501 YLR464WYLR464W 651 nt10.1□□□□□ -0.79
AVT7P40501 RRD1YIL153W 1182 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT7P40501 RTG1YOL067C 534 nt10.05□□□□□ -0.8
AVT7P40501 LCB1YMR296C 1677 nt10.03□□□□□ -0.8
AVT7P40501 FMP52YER004W 696 nt10.02□□□□□ -0.81
AVT7P40501 YFL054CYFL054C 1941 nt10□□□□□ -0.81
AVT7P40501 DED1YOR204W 1815 nt9.99□□□□□ -0.81
AVT7P40501 YCL042WYCL042W 360 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT7P40501 FRD1YEL047C 1413 nt9.97□□□□□ -0.81
AVT7P40501 PCM1YEL058W 1674 nt9.94□□□□□ -0.82
AVT7P40501 HUA1YGR268C 597 nt9.94□□□□□ -0.82
AVT7P40501 SIM1YIL123W 1431 nt9.93□□□□□ -0.82
AVT7P40501 SPT8YLR055C 1809 nt9.92□□□□□ -0.82
AVT7P40501 SOR2YDL246C 1074 nt9.91□□□□□ -0.82
AVT7P40501 Q0182Q0182 405 nt9.91□□□□□ -0.82
AVT7P40501 SOR1YJR159W 1074 nt9.91□□□□□ -0.82
AVT7P40501 FMT1YBL013W 1206 nt9.9□□□□□ -0.82
AVT7P40501 YLR235CYLR235C 399 nt9.88□□□□□ -0.83
AVT7P40501 PTH1YHR189W 573 nt9.87□□□□□ -0.83
AVT7P40501 SNF6YHL025W 999 nt9.86□□□□□ -0.83
AVT7P40501 CWP1YKL096W 720 nt9.85□□□□□ -0.83
AVT7P40501 ADH2YMR303C 1047 nt9.85□□□□□ -0.83
AVT7P40501 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.84□□□□□ -0.83
AVT7P40501 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.84□□□□□ -0.83
AVT7P40501 YKL030WYKL030W 606 nt9.84□□□□□ -0.83
AVT7P40501 BIO4YNR057C 714 nt9.83□□□□□ -0.84
AVT7P40501 UBX6YJL048C 1191 nt9.82□□□□□ -0.84
AVT7P40501 LYS4YDR234W 2082 nt9.81□□□□□ -0.84
AVT7P40501 BOR1YNL275W 1731 nt9.76□□□□□ -0.85
AVT7P40501 SWE1YJL187C 2460 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT7P40501 ERF2YLR246W 1080 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT7P40501 UME6YDR207C 2511 nt9.75□□□□□ -0.85
AVT7P40501 YDR094WYDR094W 336 nt9.74□□□□□ -0.85
AVT7P40501 YIH1YCR059C 777 nt9.73□□□□□ -0.85
AVT7P40501 CRR1YLR213C 1269 nt9.69□□□□□ -0.86
AVT7P40501 DIC1YLR348C 897 nt9.69□□□□□ -0.86
AVT7P40501 TIM23YNR017W 669 nt9.69□□□□□ -0.86
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