Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 DCW1YKL046C 1350 nt10.88□□□□□ -0.67
XBP1P40489 IMP2'YIL154C 1041 nt10.87□□□□□ -0.67
XBP1P40489 MOT3YMR070W 1473 nt10.86□□□□□ -0.67
XBP1P40489 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt10.85□□□□□ -0.67
XBP1P40489 DSK2YMR276W 1122 nt10.83□□□□□ -0.68
XBP1P40489 BDF1YLR399C 2061 nt10.81□□□□□ -0.68
XBP1P40489 FMP45YDL222C 930 nt10.78□□□□□ -0.68
XBP1P40489 YDR095CYDR095C 411 nt10.78□□□□□ -0.68
XBP1P40489 YMR090WYMR090W 684 nt10.74□□□□□ -0.69
XBP1P40489 EMI2YDR516C 1503 nt10.74□□□□□ -0.69
XBP1P40489 YJL152WYJL152W 360 nt10.71□□□□□ -0.69
XBP1P40489 YCH1YGR203W 447 nt10.7□□□□□ -0.7
XBP1P40489 YLR236CYLR236C 324 nt10.7□□□□□ -0.7
XBP1P40489 YPR011CYPR011C 981 nt10.69□□□□□ -0.7
XBP1P40489 TAT1YBR069C 1860 nt10.67□□□□□ -0.7
XBP1P40489 SIS1YNL007C 1059 nt10.66□□□□□ -0.7
XBP1P40489 YBR220CYBR220C 1683 nt10.64□□□□□ -0.71
XBP1P40489 IDH1YNL037C 1083 nt10.64□□□□□ -0.71
XBP1P40489 YDL221WYDL221W 552 nt10.61□□□□□ -0.71
XBP1P40489 RPP2AYOL039W 321 nt10.61□□□□□ -0.71
XBP1P40489 CAC2YML102W 1407 nt10.58□□□□□ -0.72
XBP1P40489 PTP1YDL230W 1008 nt10.57□□□□□ -0.72
XBP1P40489 MRPL8YJL063C 717 nt10.57□□□□□ -0.72
XBP1P40489 ERV46YAL042W 1248 nt10.55□□□□□ -0.72
XBP1P40489 SDH1YKL148C 1923 nt10.54□□□□□ -0.72
XBP1P40489 LPX1YOR084W 1164 nt10.52□□□□□ -0.73
XBP1P40489 TIR4YOR009W 1464 nt10.52□□□□□ -0.73
XBP1P40489 YDR433WYDR433W 441 nt10.51□□□□□ -0.73
XBP1P40489 GBP2YCL011C 1284 nt10.48□□□□□ -0.73
XBP1P40489 ADO1YJR105W 1023 nt10.46□□□□□ -0.73
XBP1P40489 YKR040CYKR040C 504 nt10.46□□□□□ -0.73
XBP1P40489 PET9YBL030C 957 nt10.45□□□□□ -0.74
XBP1P40489 SCC4YER147C 1875 nt10.44□□□□□ -0.74
XBP1P40489 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.43□□□□□ -0.74
XBP1P40489 ART5YGR068C 1761 nt10.43□□□□□ -0.74
XBP1P40489 IRC15YPL017C 1500 nt10.41□□□□□ -0.74
XBP1P40489 YMR057CYMR057C 372 nt10.39□□□□□ -0.75
XBP1P40489 SPP1YPL138C 1062 nt10.38□□□□□ -0.75
XBP1P40489 GIS3YLR094C 1509 nt10.38□□□□□ -0.75
XBP1P40489 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.37□□□□□ -0.75
XBP1P40489 YEL076CYEL076C 651 nt10.37□□□□□ -0.75
XBP1P40489 YLR464WYLR464W 651 nt10.37□□□□□ -0.75
XBP1P40489 GFD2YCL036W 1701 nt10.36□□□□□ -0.75
XBP1P40489 TCD2YKL027W 1344 nt10.34□□□□□ -0.75
XBP1P40489 SEC11YIR022W 504 nt10.34□□□□□ -0.75
XBP1P40489 MXR2YCL033C 507 nt10.33□□□□□ -0.76
XBP1P40489 PCH2YBR186W 1695 nt10.33□□□□□ -0.76
XBP1P40489 RTS2YOR077W 699 nt10.32□□□□□ -0.76
XBP1P40489 RTG1YOL067C 534 nt10.31□□□□□ -0.76
XBP1P40489 PAC11YDR488C 1602 nt10.28□□□□□ -0.76
XBP1P40489 GUT2YIL155C 1950 nt10.28□□□□□ -0.76
XBP1P40489 YSC84YHR016C 1407 nt10.24□□□□□ -0.77
XBP1P40489 HUA1YGR268C 597 nt10.22□□□□□ -0.77
XBP1P40489 FPS1YLL043W 2010 nt10.19□□□□□ -0.78
XBP1P40489 CUE1YMR264W 612 nt10.17□□□□□ -0.78
XBP1P40489 RRD1YIL153W 1182 nt10.16□□□□□ -0.78
XBP1P40489 YCL042WYCL042W 360 nt10.16□□□□□ -0.78
XBP1P40489 DED1YOR204W 1815 nt10.16□□□□□ -0.78
XBP1P40489 FRD1YEL047C 1413 nt10.16□□□□□ -0.78
XBP1P40489 YHL050CYHL050C 2094 nt10.14□□□□□ -0.79
XBP1P40489 UBX6YJL048C 1191 nt10.14□□□□□ -0.79
XBP1P40489 YNL195CYNL195C 786 nt10.14□□□□□ -0.79
XBP1P40489 RRT12YCR045C 1476 nt10.13□□□□□ -0.79
XBP1P40489 YIL100WYIL100W 354 nt10.12□□□□□ -0.79
XBP1P40489 YLR235CYLR235C 399 nt10.1□□□□□ -0.79
XBP1P40489 SOR2YDL246C 1074 nt10.09□□□□□ -0.79
XBP1P40489 SOR1YJR159W 1074 nt10.09□□□□□ -0.79
XBP1P40489 FMP52YER004W 696 nt10.08□□□□□ -0.8
XBP1P40489 RTF1YGL244W 1677 nt10.07□□□□□ -0.8
XBP1P40489 YKL030WYKL030W 606 nt10.07□□□□□ -0.8
XBP1P40489 PTH1YHR189W 573 nt10.05□□□□□ -0.8
XBP1P40489 PIB2YGL023C 1908 nt10.05□□□□□ -0.8
XBP1P40489 YDR094WYDR094W 336 nt10.04□□□□□ -0.8
XBP1P40489 FMT1YBL013W 1206 nt10.03□□□□□ -0.8
XBP1P40489 BOP3YNL042W 1191 nt10.01□□□□□ -0.81
XBP1P40489 CWP1YKL096W 720 nt9.97□□□□□ -0.81
XBP1P40489 LCB1YMR296C 1677 nt9.95□□□□□ -0.82
XBP1P40489 NVJ2YPR091C 2313 nt9.93□□□□□ -0.82
XBP1P40489 ADH2YMR303C 1047 nt9.91□□□□□ -0.82
XBP1P40489 PTK1YKL198C 1989 nt9.88□□□□□ -0.83
XBP1P40489 SNF6YHL025W 999 nt9.88□□□□□ -0.83
XBP1P40489 TIM23YNR017W 669 nt9.88□□□□□ -0.83
XBP1P40489 DIC1YLR348C 897 nt9.86□□□□□ -0.83
XBP1P40489 PCM1YEL058W 1674 nt9.86□□□□□ -0.83
XBP1P40489 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt9.84□□□□□ -0.83
XBP1P40489 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.81□□□□□ -0.84
XBP1P40489 YLR179CYLR179C 606 nt9.81□□□□□ -0.84
XBP1P40489 YPR064WYPR064W 420 nt9.8□□□□□ -0.84
XBP1P40489 RNQ1YCL028W 1218 nt9.8□□□□□ -0.84
XBP1P40489 NCP1YHR042W 2076 nt9.79□□□□□ -0.84
XBP1P40489 YIH1YCR059C 777 nt9.77□□□□□ -0.85
XBP1P40489 YFL054CYFL054C 1941 nt9.76□□□□□ -0.85
XBP1P40489 YFR018CYFR018C 1092 nt9.75□□□□□ -0.85
XBP1P40489 RRT5YFR032C 870 nt9.74□□□□□ -0.85
XBP1P40489 Q0182Q0182 405 nt9.73□□□□□ -0.85
XBP1P40489 TAD3YLR316C 969 nt9.73□□□□□ -0.85
XBP1P40489 PAU16YKL224C 372 nt9.69□□□□□ -0.86
XBP1P40489 AHT1YHR093W 549 nt9.68□□□□□ -0.86
XBP1P40489 AQY1YPR192W 918 nt9.68□□□□□ -0.86
XBP1P40489 WSC2YNL283C 1512 nt9.66□□□□□ -0.86
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