Protein–RNA interactions for Protein: P36113

HEL1, E3 ubiquitin-protein ligase HEL1, yeastyeast

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEL1P36113 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.16□□□□□ -0.3
HEL1P36113 DSK2YMR276W 1122 nt13.14□□□□□ -0.31
HEL1P36113 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.12□□□□□ -0.31
HEL1P36113 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.12□□□□□ -0.31
HEL1P36113 ALF1YNL148C 765 nt13.11□□□□□ -0.31
HEL1P36113 YPR011CYPR011C 981 nt13.11□□□□□ -0.31
HEL1P36113 YLR236CYLR236C 324 nt13.1□□□□□ -0.31
HEL1P36113 IMP2'YIL154C 1041 nt13.09□□□□□ -0.31
HEL1P36113 YPS1YLR120C 1710 nt13.09□□□□□ -0.31
HEL1P36113 YBR220CYBR220C 1683 nt13.08□□□□□ -0.31
HEL1P36113 FMP45YDL222C 930 nt13.08□□□□□ -0.32
HEL1P36113 YDR095CYDR095C 411 nt13.06□□□□□ -0.32
HEL1P36113 EMI2YDR516C 1503 nt13□□□□□ -0.33
HEL1P36113 YCH1YGR203W 447 nt12.96□□□□□ -0.33
HEL1P36113 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.95□□□□□ -0.34
HEL1P36113 YJL152WYJL152W 360 nt12.94□□□□□ -0.34
HEL1P36113 SIS1YNL007C 1059 nt12.94□□□□□ -0.34
HEL1P36113 NVJ2YPR091C 2313 nt12.91□□□□□ -0.34
HEL1P36113 YMR090WYMR090W 684 nt12.9□□□□□ -0.34
HEL1P36113 SDH1YKL148C 1923 nt12.85□□□□□ -0.35
HEL1P36113 YDL221WYDL221W 552 nt12.84□□□□□ -0.35
HEL1P36113 ERV46YAL042W 1248 nt12.84□□□□□ -0.35
HEL1P36113 IDH1YNL037C 1083 nt12.84□□□□□ -0.35
HEL1P36113 LPX1YOR084W 1164 nt12.84□□□□□ -0.35
HEL1P36113 TIR4YOR009W 1464 nt12.84□□□□□ -0.35
HEL1P36113 MRPL8YJL063C 717 nt12.8□□□□□ -0.36
HEL1P36113 RPP2AYOL039W 321 nt12.8□□□□□ -0.36
HEL1P36113 PCH2YBR186W 1695 nt12.78□□□□□ -0.36
HEL1P36113 GUT2YIL155C 1950 nt12.77□□□□□ -0.37
HEL1P36113 CAC2YML102W 1407 nt12.77□□□□□ -0.37
HEL1P36113 PTP1YDL230W 1008 nt12.73□□□□□ -0.37
HEL1P36113 YDR433WYDR433W 441 nt12.72□□□□□ -0.37
HEL1P36113 SPP1YPL138C 1062 nt12.71□□□□□ -0.37
HEL1P36113 ART5YGR068C 1761 nt12.7□□□□□ -0.38
HEL1P36113 GBP2YCL011C 1284 nt12.68□□□□□ -0.38
HEL1P36113 YKR040CYKR040C 504 nt12.67□□□□□ -0.38
HEL1P36113 SEC11YIR022W 504 nt12.66□□□□□ -0.38
HEL1P36113 PET9YBL030C 957 nt12.65□□□□□ -0.38
HEL1P36113 SCC4YER147C 1875 nt12.63□□□□□ -0.39
HEL1P36113 GFD2YCL036W 1701 nt12.63□□□□□ -0.39
HEL1P36113 YMR057CYMR057C 372 nt12.62□□□□□ -0.39
HEL1P36113 PIB2YGL023C 1908 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL1P36113 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL1P36113 YEL076CYEL076C 651 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL1P36113 ADO1YJR105W 1023 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL1P36113 YLR464WYLR464W 651 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL1P36113 MXR2YCL033C 507 nt12.61□□□□□ -0.39
HEL1P36113 RTG1YOL067C 534 nt12.6□□□□□ -0.39
HEL1P36113 IRC15YPL017C 1500 nt12.58□□□□□ -0.4
HEL1P36113 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.58□□□□□ -0.4
HEL1P36113 TCD2YKL027W 1344 nt12.5□□□□□ -0.41
HEL1P36113 GIS3YLR094C 1509 nt12.5□□□□□ -0.41
HEL1P36113 YSC84YHR016C 1407 nt12.45□□□□□ -0.42
HEL1P36113 FPS1YLL043W 2010 nt12.44□□□□□ -0.42
HEL1P36113 RTS2YOR077W 699 nt12.43□□□□□ -0.42
HEL1P36113 DED1YOR204W 1815 nt12.43□□□□□ -0.42
HEL1P36113 YHL050CYHL050C 2094 nt12.41□□□□□ -0.42
HEL1P36113 RRD1YIL153W 1182 nt12.4□□□□□ -0.42
HEL1P36113 RTF1YGL244W 1677 nt12.38□□□□□ -0.43
HEL1P36113 FRD1YEL047C 1413 nt12.38□□□□□ -0.43
HEL1P36113 Q0182Q0182 405 nt12.38□□□□□ -0.43
HEL1P36113 UBX6YJL048C 1191 nt12.38□□□□□ -0.43
HEL1P36113 HUA1YGR268C 597 nt12.34□□□□□ -0.43
HEL1P36113 CUE1YMR264W 612 nt12.31□□□□□ -0.44
HEL1P36113 SOR2YDL246C 1074 nt12.28□□□□□ -0.44
HEL1P36113 SOR1YJR159W 1074 nt12.28□□□□□ -0.44
HEL1P36113 FMT1YBL013W 1206 nt12.27□□□□□ -0.45
HEL1P36113 PTK1YKL198C 1989 nt12.27□□□□□ -0.45
HEL1P36113 YCL042WYCL042W 360 nt12.26□□□□□ -0.45
HEL1P36113 RRT12YCR045C 1476 nt12.26□□□□□ -0.45
HEL1P36113 PTH1YHR189W 573 nt12.23□□□□□ -0.45
HEL1P36113 BOP3YNL042W 1191 nt12.22□□□□□ -0.45
HEL1P36113 YDR094WYDR094W 336 nt12.2□□□□□ -0.46
HEL1P36113 FMP52YER004W 696 nt12.19□□□□□ -0.46
HEL1P36113 YLR235CYLR235C 399 nt12.19□□□□□ -0.46
HEL1P36113 YKL030WYKL030W 606 nt12.18□□□□□ -0.46
HEL1P36113 YIL100WYIL100W 354 nt12.14□□□□□ -0.47
HEL1P36113 LCB1YMR296C 1677 nt12.1□□□□□ -0.47
HEL1P36113 CWP1YKL096W 720 nt12.1□□□□□ -0.47
HEL1P36113 ADH2YMR303C 1047 nt12.07□□□□□ -0.48
HEL1P36113 UME6YDR207C 2511 nt12.06□□□□□ -0.48
HEL1P36113 NCP1YHR042W 2076 nt12.04□□□□□ -0.48
HEL1P36113 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.02□□□□□ -0.49
HEL1P36113 YNL195CYNL195C 786 nt12.02□□□□□ -0.49
HEL1P36113 BOR1YNL275W 1731 nt12.01□□□□□ -0.49
HEL1P36113 DIC1YLR348C 897 nt11.98□□□□□ -0.49
HEL1P36113 PCM1YEL058W 1674 nt11.97□□□□□ -0.49
HEL1P36113 TIM23YNR017W 669 nt11.97□□□□□ -0.49
HEL1P36113 SNF6YHL025W 999 nt11.95□□□□□ -0.5
HEL1P36113 YFL054CYFL054C 1941 nt11.93□□□□□ -0.5
HEL1P36113 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.91□□□□□ -0.5
HEL1P36113 SPT8YLR055C 1809 nt11.9□□□□□ -0.5
HEL1P36113 YLR179CYLR179C 606 nt11.88□□□□□ -0.51
HEL1P36113 RNQ1YCL028W 1218 nt11.88□□□□□ -0.51
HEL1P36113 YIH1YCR059C 777 nt11.87□□□□□ -0.51
HEL1P36113 YFR018CYFR018C 1092 nt11.86□□□□□ -0.51
HEL1P36113 YPR064WYPR064W 420 nt11.83□□□□□ -0.52
HEL1P36113 PAU16YKL224C 372 nt11.82□□□□□ -0.52
HEL1P36113 WSC2YNL283C 1512 nt11.81□□□□□ -0.52
HEL1P36113 AHT1YHR093W 549 nt11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.8 ms