Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Cnga1P29974 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cnga1P29974 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Cnga1P29974 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Cnga1P29974 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Cnga1P29974 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cnga1P29974 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cnga1P29974 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cnga1P29974 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.32■■■■□ 3.72
Cnga1P29974 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
Cnga1P29974 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cnga1P29974 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cnga1P29974 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Cnga1P29974 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cnga1P29974 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Cnga1P29974 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Cnga1P29974 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Cnga1P29974 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Cnga1P29974 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Cnga1P29974 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
Cnga1P29974 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Cnga1P29974 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Cnga1P29974 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
Cnga1P29974 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
Cnga1P29974 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Cnga1P29974 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Cnga1P29974 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Cnga1P29974 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Cnga1P29974 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Cnga1P29974 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cnga1P29974 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Cnga1P29974 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Cnga1P29974 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
Cnga1P29974 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Cnga1P29974 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Cnga1P29974 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Cnga1P29974 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Cnga1P29974 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
Cnga1P29974 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Cnga1P29974 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Cnga1P29974 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cnga1P29974 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Cnga1P29974 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Cnga1P29974 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Cnga1P29974 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Cnga1P29974 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Cnga1P29974 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Cnga1P29974 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
Cnga1P29974 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Cnga1P29974 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Cnga1P29974 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Cnga1P29974 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Cnga1P29974 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Cnga1P29974 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Cnga1P29974 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Cnga1P29974 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Cnga1P29974 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
Cnga1P29974 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Cnga1P29974 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
Cnga1P29974 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
Cnga1P29974 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cnga1P29974 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Cnga1P29974 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Cnga1P29974 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Cnga1P29974 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Cnga1P29974 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Cnga1P29974 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
Cnga1P29974 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Cnga1P29974 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Cnga1P29974 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cnga1P29974 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Cnga1P29974 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Cnga1P29974 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
Cnga1P29974 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
Cnga1P29974 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Cnga1P29974 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Cnga1P29974 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
Cnga1P29974 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Cnga1P29974 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms