Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Myo5bP21271 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Myo5bP21271 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Myo5bP21271 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
Myo5bP21271 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Myo5bP21271 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Myo5bP21271 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Myo5bP21271 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Myo5bP21271 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Myo5bP21271 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Myo5bP21271 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Myo5bP21271 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Myo5bP21271 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Myo5bP21271 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Myo5bP21271 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Myo5bP21271 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
Myo5bP21271 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Myo5bP21271 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Myo5bP21271 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Myo5bP21271 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Myo5bP21271 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Myo5bP21271 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Myo5bP21271 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Myo5bP21271 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Myo5bP21271 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Myo5bP21271 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Myo5bP21271 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Myo5bP21271 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Myo5bP21271 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Myo5bP21271 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Myo5bP21271 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Myo5bP21271 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Myo5bP21271 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Myo5bP21271 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
Myo5bP21271 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Myo5bP21271 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Myo5bP21271 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Myo5bP21271 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Myo5bP21271 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Myo5bP21271 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Myo5bP21271 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Myo5bP21271 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Myo5bP21271 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Myo5bP21271 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Myo5bP21271 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Myo5bP21271 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Myo5bP21271 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Myo5bP21271 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Myo5bP21271 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Myo5bP21271 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Myo5bP21271 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Myo5bP21271 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Myo5bP21271 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo5bP21271 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Myo5bP21271 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Myo5bP21271 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Myo5bP21271 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Myo5bP21271 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Myo5bP21271 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5bP21271 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Myo5bP21271 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Myo5bP21271 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Myo5bP21271 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Myo5bP21271 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Myo5bP21271 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Myo5bP21271 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Myo5bP21271 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Myo5bP21271 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Myo5bP21271 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Myo5bP21271 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Myo5bP21271 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Myo5bP21271 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Myo5bP21271 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Myo5bP21271 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Myo5bP21271 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Myo5bP21271 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Myo5bP21271 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5bP21271 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Myo5bP21271 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Myo5bP21271 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myo5bP21271 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Myo5bP21271 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Myo5bP21271 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
Myo5bP21271 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Myo5bP21271 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Myo5bP21271 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Myo5bP21271 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Myo5bP21271 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Myo5bP21271 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Myo5bP21271 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Myo5bP21271 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Myo5bP21271 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Myo5bP21271 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Myo5bP21271 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms