Protein–RNA interactions for Protein: P20612

Gnat1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnat1P20612 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Gnat1P20612 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Gnat1P20612 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gnat1P20612 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gnat1P20612 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Gnat1P20612 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Gnat1P20612 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gnat1P20612 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gnat1P20612 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Gnat1P20612 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gnat1P20612 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Gnat1P20612 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Gnat1P20612 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Gnat1P20612 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Gnat1P20612 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Gnat1P20612 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gnat1P20612 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Gnat1P20612 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Gnat1P20612 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Gnat1P20612 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gnat1P20612 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Gnat1P20612 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Gnat1P20612 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Gnat1P20612 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gnat1P20612 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gnat1P20612 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gnat1P20612 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gnat1P20612 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gnat1P20612 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gnat1P20612 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Gnat1P20612 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gnat1P20612 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gnat1P20612 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gnat1P20612 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gnat1P20612 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gnat1P20612 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gnat1P20612 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gnat1P20612 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gnat1P20612 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gnat1P20612 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Gnat1P20612 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gnat1P20612 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gnat1P20612 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gnat1P20612 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gnat1P20612 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Gnat1P20612 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gnat1P20612 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Gnat1P20612 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gnat1P20612 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gnat1P20612 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gnat1P20612 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Gnat1P20612 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gnat1P20612 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gnat1P20612 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gnat1P20612 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Gnat1P20612 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Gnat1P20612 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Gnat1P20612 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Gnat1P20612 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gnat1P20612 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Gnat1P20612 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Gnat1P20612 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gnat1P20612 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Gnat1P20612 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Gnat1P20612 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Gnat1P20612 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Gnat1P20612 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Gnat1P20612 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Gnat1P20612 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Gnat1P20612 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Gnat1P20612 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Gnat1P20612 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gnat1P20612 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Gnat1P20612 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gnat1P20612 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Gnat1P20612 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Gnat1P20612 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gnat1P20612 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Gnat1P20612 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Gnat1P20612 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Gnat1P20612 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Gnat1P20612 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Gnat1P20612 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Gnat1P20612 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Gnat1P20612 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Gnat1P20612 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Gnat1P20612 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Gnat1P20612 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Gnat1P20612 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Gnat1P20612 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gnat1P20612 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Gnat1P20612 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Gnat1P20612 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Gnat1P20612 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms