Protein–RNA interactions for Protein: P16664

RGP1, Guanine nucleotide exchange factor subunit RGP1, yeastyeast

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RGP1P16664 ART5YGR068C 1761 nt13.83□□□□□ -0.2
RGP1P16664 YMR090WYMR090W 684 nt13.81□□□□□ -0.2
RGP1P16664 GFD2YCL036W 1701 nt13.8□□□□□ -0.2
RGP1P16664 TIR4YOR009W 1464 nt13.77□□□□□ -0.21
RGP1P16664 YBR220CYBR220C 1683 nt13.75□□□□□ -0.21
RGP1P16664 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.75□□□□□ -0.21
RGP1P16664 IRC15YPL017C 1500 nt13.74□□□□□ -0.21
RGP1P16664 PET9YBL030C 957 nt13.73□□□□□ -0.21
RGP1P16664 BDF1YLR399C 2061 nt13.73□□□□□ -0.21
RGP1P16664 SDH1YKL148C 1923 nt13.71□□□□□ -0.21
RGP1P16664 YCH1YGR203W 447 nt13.7□□□□□ -0.22
RGP1P16664 YLR281CYLR281C 468 nt13.7□□□□□ -0.22
RGP1P16664 WHI5YOR083W 888 nt13.67□□□□□ -0.22
RGP1P16664 RTS2YOR077W 699 nt13.63□□□□□ -0.23
RGP1P16664 GIS3YLR094C 1509 nt13.63□□□□□ -0.23
RGP1P16664 YJL152WYJL152W 360 nt13.61□□□□□ -0.23
RGP1P16664 YMR057CYMR057C 372 nt13.61□□□□□ -0.23
RGP1P16664 SCC4YER147C 1875 nt13.6□□□□□ -0.23
RGP1P16664 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt13.54□□□□□ -0.24
RGP1P16664 IMT4tM(CAU)E 72 nt13.54□□□□□ -0.24
RGP1P16664 IMT3tM(CAU)J3 72 nt13.54□□□□□ -0.24
RGP1P16664 IMT1tM(CAU)O1 72 nt13.54□□□□□ -0.24
RGP1P16664 IMT2tM(CAU)P 72 nt13.54□□□□□ -0.24
RGP1P16664 TAT1YBR069C 1860 nt13.54□□□□□ -0.24
RGP1P16664 Q0182Q0182 405 nt13.51□□□□□ -0.25
RGP1P16664 CUE1YMR264W 612 nt13.51□□□□□ -0.25
RGP1P16664 FPS1YLL043W 2010 nt13.49□□□□□ -0.25
RGP1P16664 PUS2YGL063W 1113 nt13.49□□□□□ -0.25
RGP1P16664 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.41□□□□□ -0.26
RGP1P16664 MOT3YMR070W 1473 nt13.37□□□□□ -0.27
RGP1P16664 IMP2'YIL154C 1041 nt13.37□□□□□ -0.27
RGP1P16664 DSK2YMR276W 1122 nt13.37□□□□□ -0.27
RGP1P16664 YLR236CYLR236C 324 nt13.36□□□□□ -0.27
RGP1P16664 IDH1YNL037C 1083 nt13.35□□□□□ -0.27
RGP1P16664 YPR011CYPR011C 981 nt13.33□□□□□ -0.28
RGP1P16664 YIL100WYIL100W 354 nt13.3□□□□□ -0.28
RGP1P16664 YSC84YHR016C 1407 nt13.28□□□□□ -0.28
RGP1P16664 GBP2YCL011C 1284 nt13.27□□□□□ -0.29
RGP1P16664 SEC11YIR022W 504 nt13.25□□□□□ -0.29
RGP1P16664 YHL050CYHL050C 2094 nt13.24□□□□□ -0.29
RGP1P16664 RRD1YIL153W 1182 nt13.21□□□□□ -0.29
RGP1P16664 RRT12YCR045C 1476 nt13.21□□□□□ -0.3
RGP1P16664 PCH2YBR186W 1695 nt13.21□□□□□ -0.3
RGP1P16664 DED1YOR204W 1815 nt13.18□□□□□ -0.3
RGP1P16664 FMP45YDL222C 930 nt13.17□□□□□ -0.3
RGP1P16664 YNL195CYNL195C 786 nt13.16□□□□□ -0.3
RGP1P16664 ERV46YAL042W 1248 nt13.15□□□□□ -0.3
RGP1P16664 TCD2YKL027W 1344 nt13.14□□□□□ -0.31
RGP1P16664 GUT2YIL155C 1950 nt13.14□□□□□ -0.31
RGP1P16664 YDR433WYDR433W 441 nt13.14□□□□□ -0.31
RGP1P16664 LPX1YOR084W 1164 nt13.13□□□□□ -0.31
RGP1P16664 MXR2YCL033C 507 nt13.09□□□□□ -0.31
RGP1P16664 FMT1YBL013W 1206 nt13.05□□□□□ -0.32
RGP1P16664 FMP52YER004W 696 nt13.04□□□□□ -0.32
RGP1P16664 YKR040CYKR040C 504 nt13.03□□□□□ -0.32
RGP1P16664 PIB2YGL023C 1908 nt13□□□□□ -0.33
RGP1P16664 SOR2YDL246C 1074 nt12.95□□□□□ -0.34
RGP1P16664 SOR1YJR159W 1074 nt12.95□□□□□ -0.34
RGP1P16664 FRD1YEL047C 1413 nt12.92□□□□□ -0.34
RGP1P16664 PCM1YEL058W 1674 nt12.92□□□□□ -0.34
RGP1P16664 RTF1YGL244W 1677 nt12.9□□□□□ -0.34
RGP1P16664 NCP1YHR042W 2076 nt12.9□□□□□ -0.34
RGP1P16664 ADH2YMR303C 1047 nt12.89□□□□□ -0.35
RGP1P16664 CWP1YKL096W 720 nt12.88□□□□□ -0.35
RGP1P16664 YCL042WYCL042W 360 nt12.87□□□□□ -0.35
RGP1P16664 BOP3YNL042W 1191 nt12.86□□□□□ -0.35
RGP1P16664 LCB1YMR296C 1677 nt12.86□□□□□ -0.35
RGP1P16664 SPP1YPL138C 1062 nt12.81□□□□□ -0.36
RGP1P16664 SNF6YHL025W 999 nt12.8□□□□□ -0.36
RGP1P16664 SIM1YIL123W 1431 nt12.75□□□□□ -0.37
RGP1P16664 PTK1YKL198C 1989 nt12.74□□□□□ -0.37
RGP1P16664 BIO4YNR057C 714 nt12.73□□□□□ -0.37
RGP1P16664 YIH1YCR059C 777 nt12.7□□□□□ -0.38
RGP1P16664 RNQ1YCL028W 1218 nt12.66□□□□□ -0.38
RGP1P16664 DIC1YLR348C 897 nt12.62□□□□□ -0.39
RGP1P16664 LYS4YDR234W 2082 nt12.61□□□□□ -0.39
RGP1P16664 YGR139WYGR139W 339 nt12.61□□□□□ -0.39
RGP1P16664 PTH1YHR189W 573 nt12.61□□□□□ -0.39
RGP1P16664 YLL053CYLL053C 459 nt12.59□□□□□ -0.39
RGP1P16664 YLR235CYLR235C 399 nt12.57□□□□□ -0.4
RGP1P16664 RTG1YOL067C 534 nt12.53□□□□□ -0.4
RGP1P16664 ERF2YLR246W 1080 nt12.52□□□□□ -0.41
RGP1P16664 FTR1YER145C 1215 nt12.5□□□□□ -0.41
RGP1P16664 CRR1YLR213C 1269 nt12.5□□□□□ -0.41
RGP1P16664 TIM23YNR017W 669 nt12.47□□□□□ -0.41
RGP1P16664 ATF2YGR177C 1608 nt12.47□□□□□ -0.41
RGP1P16664 YFL054CYFL054C 1941 nt12.47□□□□□ -0.41
RGP1P16664 YKL030WYKL030W 606 nt12.46□□□□□ -0.41
RGP1P16664 GAL1YBR020W 1587 nt12.45□□□□□ -0.42
RGP1P16664 TRM5YHR070W 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
RGP1P16664 YLR179CYLR179C 606 nt12.4□□□□□ -0.42
RGP1P16664 SPT8YLR055C 1809 nt12.39□□□□□ -0.43
RGP1P16664 YFL067WYFL067W 528 nt12.39□□□□□ -0.43
RGP1P16664 PAC11YDR488C 1602 nt12.39□□□□□ -0.43
RGP1P16664 AQY1YPR192W 918 nt12.38□□□□□ -0.43
RGP1P16664 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.37□□□□□ -0.43
RGP1P16664 YEL076CYEL076C 651 nt12.37□□□□□ -0.43
RGP1P16664 YLR464WYLR464W 651 nt12.37□□□□□ -0.43
RGP1P16664 MRPL8YJL063C 717 nt12.36□□□□□ -0.43
RGP1P16664 MIC10YCL057C-A 294 nt12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 109.6 ms