Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vpreb2P13373 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vpreb2P13373 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vpreb2P13373 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vpreb2P13373 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vpreb2P13373 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vpreb2P13373 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Vpreb2P13373 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Vpreb2P13373 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Vpreb2P13373 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Vpreb2P13373 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vpreb2P13373 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vpreb2P13373 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vpreb2P13373 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vpreb2P13373 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vpreb2P13373 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vpreb2P13373 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vpreb2P13373 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Vpreb2P13373 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Vpreb2P13373 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Vpreb2P13373 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vpreb2P13373 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vpreb2P13373 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Vpreb2P13373 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms