Protein–RNA interactions for Protein: P13297

Msx1, Homeobox protein MSX-1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx1P13297 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Msx1P13297 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msx1P13297 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msx1P13297 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msx1P13297 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msx1P13297 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Msx1P13297 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Msx1P13297 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Msx1P13297 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Msx1P13297 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Msx1P13297 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Msx1P13297 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Msx1P13297 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msx1P13297 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Msx1P13297 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Msx1P13297 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Msx1P13297 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Msx1P13297 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Msx1P13297 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Msx1P13297 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Msx1P13297 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Msx1P13297 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msx1P13297 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Msx1P13297 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msx1P13297 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Msx1P13297 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Msx1P13297 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Msx1P13297 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Msx1P13297 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Msx1P13297 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Msx1P13297 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Msx1P13297 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Msx1P13297 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Msx1P13297 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msx1P13297 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msx1P13297 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Msx1P13297 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Msx1P13297 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Msx1P13297 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Msx1P13297 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msx1P13297 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Msx1P13297 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msx1P13297 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Msx1P13297 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Msx1P13297 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Msx1P13297 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Msx1P13297 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Msx1P13297 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msx1P13297 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Msx1P13297 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Msx1P13297 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msx1P13297 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Msx1P13297 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Msx1P13297 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Msx1P13297 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msx1P13297 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Msx1P13297 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Msx1P13297 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msx1P13297 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Msx1P13297 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Msx1P13297 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Msx1P13297 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Msx1P13297 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Msx1P13297 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Msx1P13297 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx1P13297 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx1P13297 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Msx1P13297 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Msx1P13297 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Msx1P13297 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Msx1P13297 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Msx1P13297 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msx1P13297 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Msx1P13297 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Msx1P13297 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Msx1P13297 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Msx1P13297 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Msx1P13297 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Msx1P13297 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Msx1P13297 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms