Protein–RNA interactions for Protein: P0CG09

C2cd4d, C2 calcium-dependent domain-containing protein 4D, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2cd4dP0CG09 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C2cd4dP0CG09 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C2cd4dP0CG09 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C2cd4dP0CG09 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
C2cd4dP0CG09 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C2cd4dP0CG09 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2cd4dP0CG09 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C2cd4dP0CG09 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C2cd4dP0CG09 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C2cd4dP0CG09 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C2cd4dP0CG09 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C2cd4dP0CG09 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C2cd4dP0CG09 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C2cd4dP0CG09 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C2cd4dP0CG09 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C2cd4dP0CG09 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C2cd4dP0CG09 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2cd4dP0CG09 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C2cd4dP0CG09 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C2cd4dP0CG09 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C2cd4dP0CG09 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C2cd4dP0CG09 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C2cd4dP0CG09 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C2cd4dP0CG09 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C2cd4dP0CG09 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2cd4dP0CG09 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2cd4dP0CG09 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2cd4dP0CG09 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2cd4dP0CG09 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2cd4dP0CG09 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2cd4dP0CG09 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2cd4dP0CG09 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2cd4dP0CG09 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C2cd4dP0CG09 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C2cd4dP0CG09 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
C2cd4dP0CG09 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C2cd4dP0CG09 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
C2cd4dP0CG09 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C2cd4dP0CG09 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
C2cd4dP0CG09 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C2cd4dP0CG09 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
C2cd4dP0CG09 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
C2cd4dP0CG09 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
C2cd4dP0CG09 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
C2cd4dP0CG09 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
C2cd4dP0CG09 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
C2cd4dP0CG09 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
C2cd4dP0CG09 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
C2cd4dP0CG09 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
C2cd4dP0CG09 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
C2cd4dP0CG09 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
C2cd4dP0CG09 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
C2cd4dP0CG09 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2cd4dP0CG09 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
C2cd4dP0CG09 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
C2cd4dP0CG09 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
C2cd4dP0CG09 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
C2cd4dP0CG09 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2cd4dP0CG09 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
C2cd4dP0CG09 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
C2cd4dP0CG09 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
C2cd4dP0CG09 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2cd4dP0CG09 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
C2cd4dP0CG09 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd4dP0CG09 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C2cd4dP0CG09 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd4dP0CG09 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C2cd4dP0CG09 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C2cd4dP0CG09 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C2cd4dP0CG09 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2cd4dP0CG09 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C2cd4dP0CG09 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C2cd4dP0CG09 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C2cd4dP0CG09 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C2cd4dP0CG09 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C2cd4dP0CG09 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C2cd4dP0CG09 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd4dP0CG09 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C2cd4dP0CG09 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd4dP0CG09 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C2cd4dP0CG09 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms