Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hoxa9P09631 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxa9P09631 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxa9P09631 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hoxa9P09631 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hoxa9P09631 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hoxa9P09631 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hoxa9P09631 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Hoxa9P09631 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Hoxa9P09631 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Hoxa9P09631 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Hoxa9P09631 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Hoxa9P09631 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxa9P09631 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Hoxa9P09631 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Hoxa9P09631 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxa9P09631 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxa9P09631 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxa9P09631 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa9P09631 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Hoxa9P09631 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxa9P09631 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Hoxa9P09631 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxa9P09631 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa9P09631 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa9P09631 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hoxa9P09631 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Hoxa9P09631 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Hoxa9P09631 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Hoxa9P09631 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Hoxa9P09631 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Hoxa9P09631 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Hoxa9P09631 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Hoxa9P09631 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Hoxa9P09631 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Hoxa9P09631 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxa9P09631 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Hoxa9P09631 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa9P09631 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hoxa9P09631 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hoxa9P09631 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxa9P09631 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hoxa9P09631 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hoxa9P09631 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa9P09631 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Hoxa9P09631 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa9P09631 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Hoxa9P09631 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Hoxa9P09631 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Hoxa9P09631 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Hoxa9P09631 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxa9P09631 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxa9P09631 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Hoxa9P09631 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Hoxa9P09631 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Hoxa9P09631 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa9P09631 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa9P09631 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Hoxa9P09631 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Hoxa9P09631 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa9P09631 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Hoxa9P09631 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Hoxa9P09631 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Hoxa9P09631 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa9P09631 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Hoxa9P09631 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Hoxa9P09631 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxa9P09631 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Hoxa9P09631 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hoxa9P09631 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa9P09631 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Hoxa9P09631 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa9P09631 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa9P09631 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa9P09631 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa9P09631 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxa9P09631 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Hoxa9P09631 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms