Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P01649 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01649 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
P01649 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01649 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
P01649 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P01649 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
P01649 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
P01649 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
P01649 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
P01649 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
P01649 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01649 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
P01649 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P01649 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01649 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P01649 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
P01649 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01649 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P01649 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P01649 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
P01649 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
P01649 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
P01649 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
P01649 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01649 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P01649 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P01649 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P01649 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P01649 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P01649 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P01649 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
P01649 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01649 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
P01649 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
P01649 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
P01649 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P01649 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
P01649 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
P01649 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
P01649 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P01649 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P01649 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
P01649 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
P01649 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
P01649 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
P01649 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01649 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
P01649 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P01649 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P01649 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P01649 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P01649 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
P01649 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P01649 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
P01649 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01649 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
P01649 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
P01649 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01649 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
P01649 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
P01649 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
P01649 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
P01649 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
P01649 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
P01649 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01649 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01649 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01649 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01649 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01649 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01649 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01649 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01649 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
P01649 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01649 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01649 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
P01649 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01649 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01649 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01649 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01649 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01649 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01649 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
P01649 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01649 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01649 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01649 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
P01649 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
P01649 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
P01649 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
P01649 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
P01649 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
P01649 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
P01649 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01649 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01649 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01649 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
P01649 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
P01649 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms