Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
C4bP01029 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
C4bP01029 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
C4bP01029 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
C4bP01029 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
C4bP01029 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
C4bP01029 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
C4bP01029 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
C4bP01029 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
C4bP01029 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
C4bP01029 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
C4bP01029 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
C4bP01029 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
C4bP01029 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
C4bP01029 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
C4bP01029 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
C4bP01029 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
C4bP01029 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C4bP01029 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
C4bP01029 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
C4bP01029 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
C4bP01029 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC35.28■■■■□ 3.24
C4bP01029 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
C4bP01029 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
C4bP01029 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
C4bP01029 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
C4bP01029 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
C4bP01029 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
C4bP01029 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
C4bP01029 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
C4bP01029 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
C4bP01029 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
C4bP01029 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
C4bP01029 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
C4bP01029 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
C4bP01029 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
C4bP01029 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
C4bP01029 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35.01■■■■□ 3.19
C4bP01029 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
C4bP01029 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
C4bP01029 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
C4bP01029 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
C4bP01029 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
C4bP01029 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
C4bP01029 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
C4bP01029 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
C4bP01029 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
C4bP01029 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
C4bP01029 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
C4bP01029 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
C4bP01029 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
C4bP01029 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
C4bP01029 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
C4bP01029 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
C4bP01029 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
C4bP01029 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
C4bP01029 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
C4bP01029 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
C4bP01029 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
C4bP01029 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
C4bP01029 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
C4bP01029 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
C4bP01029 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
C4bP01029 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
C4bP01029 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
C4bP01029 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
C4bP01029 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
C4bP01029 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
C4bP01029 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
C4bP01029 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
C4bP01029 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
C4bP01029 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
C4bP01029 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4bP01029 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4bP01029 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
C4bP01029 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
C4bP01029 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
C4bP01029 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
C4bP01029 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
C4bP01029 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
C4bP01029 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
C4bP01029 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
C4bP01029 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
C4bP01029 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
C4bP01029 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
C4bP01029 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
C4bP01029 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
C4bP01029 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
C4bP01029 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
C4bP01029 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
C4bP01029 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
C4bP01029 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
C4bP01029 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
C4bP01029 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
C4bP01029 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4bP01029 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4bP01029 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
C4bP01029 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
C4bP01029 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
C4bP01029 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms