Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tcn2O88968 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tcn2O88968 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tcn2O88968 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tcn2O88968 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tcn2O88968 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tcn2O88968 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tcn2O88968 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tcn2O88968 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tcn2O88968 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Tcn2O88968 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tcn2O88968 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tcn2O88968 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tcn2O88968 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tcn2O88968 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcn2O88968 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tcn2O88968 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tcn2O88968 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tcn2O88968 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tcn2O88968 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tcn2O88968 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcn2O88968 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tcn2O88968 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tcn2O88968 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tcn2O88968 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcn2O88968 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcn2O88968 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcn2O88968 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcn2O88968 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcn2O88968 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcn2O88968 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcn2O88968 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcn2O88968 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcn2O88968 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcn2O88968 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tcn2O88968 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcn2O88968 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcn2O88968 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcn2O88968 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcn2O88968 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tcn2O88968 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcn2O88968 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcn2O88968 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcn2O88968 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcn2O88968 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcn2O88968 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcn2O88968 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcn2O88968 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcn2O88968 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcn2O88968 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcn2O88968 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Tcn2O88968 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcn2O88968 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcn2O88968 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcn2O88968 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tcn2O88968 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcn2O88968 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcn2O88968 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcn2O88968 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcn2O88968 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcn2O88968 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcn2O88968 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcn2O88968 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcn2O88968 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcn2O88968 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcn2O88968 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcn2O88968 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcn2O88968 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tcn2O88968 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcn2O88968 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcn2O88968 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tcn2O88968 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tcn2O88968 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tcn2O88968 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Tcn2O88968 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcn2O88968 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tcn2O88968 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tcn2O88968 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Tcn2O88968 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcn2O88968 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcn2O88968 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tcn2O88968 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tcn2O88968 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tcn2O88968 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tcn2O88968 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms