Protein–RNA interactions for Protein: O55230

Rad51d, DNA repair protein RAD51 homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad51dO55230 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rad51dO55230 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rad51dO55230 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad51dO55230 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rad51dO55230 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rad51dO55230 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rad51dO55230 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rad51dO55230 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rad51dO55230 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rad51dO55230 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rad51dO55230 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rad51dO55230 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rad51dO55230 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rad51dO55230 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rad51dO55230 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rad51dO55230 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rad51dO55230 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rad51dO55230 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad51dO55230 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rad51dO55230 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rad51dO55230 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad51dO55230 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rad51dO55230 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad51dO55230 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rad51dO55230 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rad51dO55230 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rad51dO55230 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rad51dO55230 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad51dO55230 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad51dO55230 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rad51dO55230 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rad51dO55230 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rad51dO55230 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rad51dO55230 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rad51dO55230 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rad51dO55230 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rad51dO55230 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rad51dO55230 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rad51dO55230 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rad51dO55230 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Rad51dO55230 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rad51dO55230 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rad51dO55230 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rad51dO55230 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Rad51dO55230 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Rad51dO55230 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad51dO55230 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad51dO55230 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rad51dO55230 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rad51dO55230 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad51dO55230 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad51dO55230 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rad51dO55230 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad51dO55230 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad51dO55230 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad51dO55230 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad51dO55230 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad51dO55230 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad51dO55230 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad51dO55230 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad51dO55230 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad51dO55230 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rad51dO55230 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rad51dO55230 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms