Protein–RNA interactions for Protein: O55183

Stc1, Stanniocalcin-1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stc1O55183 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Stc1O55183 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Stc1O55183 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Stc1O55183 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Stc1O55183 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Stc1O55183 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Stc1O55183 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Stc1O55183 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Stc1O55183 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stc1O55183 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Stc1O55183 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Stc1O55183 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Stc1O55183 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Stc1O55183 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stc1O55183 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Stc1O55183 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Stc1O55183 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Stc1O55183 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Stc1O55183 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Stc1O55183 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Stc1O55183 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Stc1O55183 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Stc1O55183 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Stc1O55183 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Stc1O55183 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Stc1O55183 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Stc1O55183 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Stc1O55183 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Stc1O55183 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Stc1O55183 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Stc1O55183 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Stc1O55183 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Stc1O55183 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Stc1O55183 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Stc1O55183 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Stc1O55183 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stc1O55183 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stc1O55183 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Stc1O55183 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Stc1O55183 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Stc1O55183 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stc1O55183 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Stc1O55183 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Stc1O55183 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Stc1O55183 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stc1O55183 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stc1O55183 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Stc1O55183 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Stc1O55183 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Stc1O55183 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Stc1O55183 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stc1O55183 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Stc1O55183 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Stc1O55183 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Stc1O55183 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Stc1O55183 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Stc1O55183 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stc1O55183 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Stc1O55183 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Stc1O55183 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Stc1O55183 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Stc1O55183 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stc1O55183 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Stc1O55183 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Stc1O55183 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Stc1O55183 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Stc1O55183 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stc1O55183 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stc1O55183 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Stc1O55183 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Stc1O55183 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Stc1O55183 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Stc1O55183 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stc1O55183 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stc1O55183 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Stc1O55183 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Stc1O55183 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stc1O55183 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Stc1O55183 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Stc1O55183 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Stc1O55183 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Stc1O55183 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Stc1O55183 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stc1O55183 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stc1O55183 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Stc1O55183 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms