Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ptpn20O55082 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ptpn20O55082 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ptpn20O55082 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn20O55082 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Ptpn20O55082 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ptpn20O55082 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ptpn20O55082 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn20O55082 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ptpn20O55082 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ptpn20O55082 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ptpn20O55082 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ptpn20O55082 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn20O55082 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ptpn20O55082 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ptpn20O55082 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ptpn20O55082 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ptpn20O55082 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn20O55082 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn20O55082 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ptpn20O55082 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ptpn20O55082 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ptpn20O55082 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ptpn20O55082 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ptpn20O55082 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ptpn20O55082 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn20O55082 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn20O55082 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ptpn20O55082 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ptpn20O55082 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ptpn20O55082 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ptpn20O55082 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ptpn20O55082 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ptpn20O55082 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn20O55082 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ptpn20O55082 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ptpn20O55082 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ptpn20O55082 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ptpn20O55082 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn20O55082 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ptpn20O55082 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ptpn20O55082 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ptpn20O55082 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn20O55082 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ptpn20O55082 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn20O55082 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ptpn20O55082 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ptpn20O55082 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ptpn20O55082 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ptpn20O55082 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn20O55082 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ptpn20O55082 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn20O55082 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ptpn20O55082 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ptpn20O55082 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ptpn20O55082 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn20O55082 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn20O55082 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ptpn20O55082 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ptpn20O55082 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ptpn20O55082 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Ptpn20O55082 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms